Fekete gombák összehasonlító elemzése bioinformatikai módszerekkel

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorHajdu, András
dc.contributor.advisorMiskei, Márton
dc.contributor.authorPócsi, Tamás
dc.contributor.departmentDE--Informatikai Kar
dc.date.accessioned2025-06-30T11:13:58Z
dc.date.available2025-06-30T11:13:58Z
dc.date.created2025
dc.description.abstractA fekete gombák extremofil élőlények, amelyek rendkívül ellenállóak a szélsőséges környezeti stresszhatásokkal szemben, mint például az Antarktisz zord körülményei. Jelen diplomamunka célja 118 fekete gomba faj és 2 kontroll faj proteomjának összehasonlító bioinformatikai elemzése volt az extrém környezethez való adaptációs mechanizmusok azonosítása érdekében. Az elemzés során ortológ csoportokat azonosítottunk (OrthoMCL), becsültük a fajok ploiditását, hierarchikus klaszterezést és GO dúsulási elemzést végeztünk, valamint prediktáltuk a fehérjék rendezetlenségét. Az eredmények jelentős változatosságot mutattak a proteomméretekben, és kimutatták, hogy a poliploiditás jellemző az antarktiszi fajokra, különösen az F. endolithicus-ra. A dúsulási elemzés specifikus géncsoportok eltérő jelenlétét tárta fel az antarktiszi és nem-antarktiszi fajok között (pl. nem riboszomális peptid szintézis, poliszacharid-bontás), ami adaptív stratégiákra utalhat. A fehérjék rendezetlenségi mintázatai szintén élőhelyhez és ploiditáshoz köthető eltéréseket mutattak, különösen a Cryomyces nemzetségben és a poliploid fajokban. Ezek az eredmények hozzájárulnak a fekete gombák extrém stressztoleranciájának molekuláris hátterének megértéséhez.
dc.description.courseAdattudomány
dc.description.degreeMSc/MA
dc.format.extent48
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/2437/394979
dc.language.isohu
dc.rights.infoHozzáférhető a 2022 decemberi felsőoktatási törvénymódosítás értelmében.
dc.subjectFekete gombák, Bioinformatika, Adaptáció, Antarktisz, Ortológ elemzés, Poliploidia, Fehérje rendezetlenség
dc.subject.dspaceInformatika
dc.titleFekete gombák összehasonlító elemzése bioinformatikai módszerekkel
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
szakdolgozat.pdf
Méret:
1.27 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
szakdolgozat
Megjelenítés
Engedélyek köteg
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
license.txt
Méret:
2.35 KB
Formátum:
Item-specific license agreed upon to submission
Leírás:
Letöltés
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Informatikai Kar)