A doktori értekezésemben részletezett kísérletek egyik célja az volt, hogy feltérképezzem a porcsejtek felszínén található fehérjék (surfaceome) dinamikusan változó minőségi és mennyiségi összetételét az in vitro chondrogenesis során. A másik cél pedig az volt, hogy megvizsgáljuk a CLU fehérje és annak interakciós partnereiből képzett hálózatot, hogy ezek a kölcsönhatások miként befolyásolják az ízületi betegségek pathomechanizmusát. A disszertációban bemutatott legfontosabb új eredményeket az alábbiakban foglalom össze:

A chondrogenikus surfaceome izolálással kapcsolatos új megállapítások: • Az általunk alkalmazott AOB alapú sejtfelszíni fehérje-dúsítási módszer alkalmazása lehetővé tette 205-238, alacsony mértékben kifejeződő fehérje azonosítását, amelyek teljes sejtlizátumból végzett proteomikai analízissel nem lettek volna detektálhatók. • Az időben konstans csökkenő expressziót mutató surfaceome fehérjék közül az ephrin receptorcsalád több tagját is sikerült kimutatnunk (EPHA3, EPHA4, EPHA5, EPHA7, EPHB1, EPHB2, EPHB3), ami arra utal, hogy az ephrin jelátvitel nemcsak a korai embryonalis fejlődésben, hanem a porcfejlődés során is jelentős szabályozó szerepet tölthet be. • A CNTFR és PODXL fehérjék csökkenő expresszióját és plazmamembrán közeli lokalizációját sikerült igazolni, mely proteineket eddig nem hoztak összefüggésbe a porcfejlődéssel. E két fehérje potenciális porcőssejt markerként hasznosíthatóak lehetnek a porcszövet-tervezést alkalmazó terápiás stratégiák fejlesztésében.

A clusterin fehérjével kapcsolatos új megállapítások: • A STRING adatbázis elemzése alapján új összefüggések derültek ki a CLU szelén metabolizmusban betöltött szerepe, valamint a CLU-plexin-semaphorin jelátviteli tengely kapcsán, melyek új kutatási irányt kínálnak az OA pathomechanizmusának mélyebb megértéséhez. • A molekuláris aktivitáson alapuló IPA hálózatelemzés 5 olyan, CLU által szabályozott útvonalat azonosított, melyeket már korábban is összefüggésbe hoztak az OA progressziójával. Ez a felismerés még tovább erősíti a CLU biomarkerként történő felhasználását az ízületi porcot érintő gyulladásos kórállapotokban.

One of the main objectives of my doctoral dissertation was to map the dynamically changing qualitative and quantitative composition of cell surface proteins (the surfaceome) of chondrocytes during in vitro chondrogenesis. A further aim was to investigate the network formed by the CLU protein and its interacting partners, in order to understand how these molecular pathways influence the pathomechanism of joint diseases. The most important novel findings presented in the dissertation are summarized below:

Novel findings related to the characterization of the chondrogenic surfaceome: • Application of the AOB–based cell surface protein enrichment method enabled the identification of 205–238 low-abundance proteins that would not have been detectable by proteomic analysis of total cell lysates. • Among the surface proteins displaying a consistently decreasing expression pattern over time, several members of the ephrin receptor family were identified (EPHA3, EPHA4, EPHA5, EPHA7, EPHB1, EPHB2, EPHB3), suggesting that ephrin signaling may play an important regulatory role not only during early embryonic development but also throughout cartilage development. • Decreasing expression pattern and proximal plasma membrane localization of CNTFR and PODXL proteins were confirmed. These proteins have not previously been associated with cartilage development and may serve as potential chondroprogenitor cell markers with relevance for the development of cartilage tissue engineering–based therapeutic strategies.

Novel findings related to the clusterin protein: • Analysis using the STRING database revealed novel associations involving CLU-related selenium metabolism and the CLU–plexin–semaphorin signaling axis, offering new research directions for a deeper understanding of the pathomechanism of OA. • Molecular activity–based IPA network analysis identified five CLU-regulated pathways that have previously been associated with OA progression. This observation further supports the potential utility of CLU as a biomarker in inflammatory conditions affecting articular cartilage.