c-Fos transzkripciós faktor hetero- és homodimerizációjának kvantitatív vizsgálata élő HeLa sejtekben

dc.contributor.advisorVámosi György
dc.contributor.authorSzalóki Nikoletta Margit
dc.contributor.departmentMolekuláris orvostudomány doktori iskolahu
dc.contributor.submitterdepDE--Általános Orvostudományi Kar -- Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet
dc.date.accessioned2015-11-29T12:20:52Z
dc.date.available2015-11-29T12:20:52Z
dc.date.defended2015-12-15
dc.date.issued2015
dc.description.abstractA c-Fos és c-Jun transzkripciós faktorok, melyek az aktivátor protein-1 (AP-1) családba tartoznak, különböző sejtfolyamatok szabályozásában vesznek részt, mint például a sejtproliferáció, differenciáció, apoptózis és onkogenezis. A c-Fos és c-Jun család fehérjéi leucin cipzárral összekapcsolódó dimerként működnek és számos emlős gén promóter és enhanszer régióiban az AP-1 szabályozó elemeihez kötődnek. A c-Jun fehérjék homodimert, illetve c-Fos fehérjékkel heterodimert alkothatnak. Ezzel szemben korábban számos közleményben leírták, hogy az izolált c-Fos leucin cipzár in vitro nem alkot stabil homodimert. Élő sejtben nem álltak rendelkezésre adatok a c-Fos homodimerizációval kapcsolatban. Kísérleteink során arra kerestük a választ, hogy a túltermelt mennyiségben jelenlevő c-Fos transzkripciós faktor képes-e homodimert alkotni, ugyanis egyes tumorok a c-Fos-t önmagában túltermelik. A dimerizáció létrejöttét fluoreszcencia rezonancia energia transzfer (FRET) technikával konfokális mikroszkóp és áramlási citométer segítségével, illetve fluoreszcencia korrelációs spektroszkópiával (FCS) vizsgáltuk élő HeLa sejtekben. Vizsgálatainkhoz ECFP-EYFP, illetve EGFP-mRFP1 donor-akceptor párral jelölt c-Fos, c-Jun fúziós fehérjéket, illetve ezek mutánsait használtuk. Dimer transzkripciós faktorok létrejöttének feltétele, hogy legyen asszociáció, ami függ a koncentrációtól és a disszociációs állandótól. Kidolgoztunk egy „FRET titrálási” módszert, melynek segítségével meghatároztuk a c-Fos‒c-Jun heterodimerek és a c-Fos homodimerek disszociációs állandóját élő sejtekben. Emellett kidolgoztunk egy eljárást a fluoreszkáló transzfektált, és nem fluoreszkáló endogén fehérjék abszolút koncentrációjának mérésére élő sejtekben, amely koncentrációkat figyelembe vettük a disszociációs állandók meghatározásánál.hu_HU
dc.description.abstractThe c-Fos and c-Jun transcription factors, members of the activator protein-1 (AP-1) complex, form heterodimers and bind to DNA via a basic leucine zipper, and regulate the cell cycle, apoptosis, differentiation, etc. Purified c-Jun leucine zipper fragments could also form stable homodimers, whereas c-Fos leucine zipper homodimers were found to be much less stable in earlier in vitro studies. The importance of c-Fos overexpression in tumors and the controversy in the literature concerning c-Fos homodimerization prompted us to investigate Fos homodimerization. FRET and molecular brightness analysis of fluorescence correlation spectroscopy data from live HeLa cells transfected with fluorescent protein-tagged c-Fos indicated that c-Fos formed homodimers. We developed a method to determine the absolute concentrations of transfected and endogenous c-Fos and c-Jun, which allowed us to determine dissociation constants of c-Fos homodimers (Kd=6.7±1.7 μM) and c-Fos–c-Jun heterodimers (on the order of 10-100 nM) from FRET titrations. Imaging fluorescence cross-correlation spectroscopy and molecular modeling simulations confirmed that c-Fos homodimers were stably associated and could bind to the chromatin. Our results establish c-Fos homodimers as a novel form of the AP-1 complex, which may be an autonomous transcription factor in c-Fos overexpressing tissues, and could contribute to tumor development.hu_HU
dc.description.correctorNE
dc.format.extent87hu_HU
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2437/219936
dc.language.isohuhu_HU
dc.language.isoenhu_HU
dc.subjectFos homodimerizációhu_HU
dc.subjectFos homodimerisationhu_HU
dc.subjecttranszkripciós faktor
dc.subjectdisszociációs állandó
dc.subjectfluoreszcencia rezonancia energia transzfer
dc.subjectkonfokális mikroszkópia
dc.subjectáramlási citometria
dc.subjectfluoreszcencia korrelációs spektroszkópia
dc.subjectlézer pásztázó citométer
dc.subjecttranscription factor
dc.subjectdissociation constant
dc.subjectfluorescence resonance energy transfer
dc.subjectconfocal microscopy
dc.subjectflow cytometry
dc.subjectfluorescence correlation spectroscopy
dc.subjectlaser scanning cytometer
dc.subject.disciplineElméleti orvostudományokhu
dc.subject.sciencefieldOrvostudományokhu
dc.titlec-Fos transzkripciós faktor hetero- és homodimerizációjának kvantitatív vizsgálata élő HeLa sejtekbenhu_HU
dc.title.translatedQuantitative examination of hetero- and homodimerization of c-Fos transcription factor in live HeLa cellshu_HU
dc.typePhD, doktori értekezéshu
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 4 (Összesen 4)
Betöltés ...
Bélyegkép
Név:
Szaloki_Nikoletta_ertekezes_titkositott.pdf
Méret:
3.51 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Értekezés
Betöltés ...
Bélyegkép
Név:
Szaloki_Nikoletta_meghivo.pdf
Méret:
165.64 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Meghívó
Betöltés ...
Bélyegkép
Név:
Szaloki_Nikoletta_tezis_magyar_titkositott.pdf
Méret:
533.02 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Tézis
Betöltés ...
Bélyegkép
Név:
Szaloki_Nikoletta_tezis_angol_titkositott.pdf
Méret:
500.46 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Short_thesis
Engedélyek köteg
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
license.txt
Méret:
1.93 KB
Formátum:
Item-specific license agreed upon to submission
Leírás: