c-Fos transzkripciós faktor hetero- és homodimerizációjának kvantitatív vizsgálata élő HeLa sejtekben
| dc.contributor.advisor | Vámosi György | |
| dc.contributor.author | Szalóki Nikoletta Margit | |
| dc.contributor.department | Molekuláris orvostudomány doktori iskola | hu |
| dc.contributor.submitterdep | DE--Általános Orvostudományi Kar -- Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet | |
| dc.date.accessioned | 2015-11-29T12:20:52Z | |
| dc.date.available | 2015-11-29T12:20:52Z | |
| dc.date.defended | 2015-12-15 | |
| dc.date.issued | 2015 | |
| dc.description.abstract | A c-Fos és c-Jun transzkripciós faktorok, melyek az aktivátor protein-1 (AP-1) családba tartoznak, különböző sejtfolyamatok szabályozásában vesznek részt, mint például a sejtproliferáció, differenciáció, apoptózis és onkogenezis. A c-Fos és c-Jun család fehérjéi leucin cipzárral összekapcsolódó dimerként működnek és számos emlős gén promóter és enhanszer régióiban az AP-1 szabályozó elemeihez kötődnek. A c-Jun fehérjék homodimert, illetve c-Fos fehérjékkel heterodimert alkothatnak. Ezzel szemben korábban számos közleményben leírták, hogy az izolált c-Fos leucin cipzár in vitro nem alkot stabil homodimert. Élő sejtben nem álltak rendelkezésre adatok a c-Fos homodimerizációval kapcsolatban. Kísérleteink során arra kerestük a választ, hogy a túltermelt mennyiségben jelenlevő c-Fos transzkripciós faktor képes-e homodimert alkotni, ugyanis egyes tumorok a c-Fos-t önmagában túltermelik. A dimerizáció létrejöttét fluoreszcencia rezonancia energia transzfer (FRET) technikával konfokális mikroszkóp és áramlási citométer segítségével, illetve fluoreszcencia korrelációs spektroszkópiával (FCS) vizsgáltuk élő HeLa sejtekben. Vizsgálatainkhoz ECFP-EYFP, illetve EGFP-mRFP1 donor-akceptor párral jelölt c-Fos, c-Jun fúziós fehérjéket, illetve ezek mutánsait használtuk. Dimer transzkripciós faktorok létrejöttének feltétele, hogy legyen asszociáció, ami függ a koncentrációtól és a disszociációs állandótól. Kidolgoztunk egy „FRET titrálási” módszert, melynek segítségével meghatároztuk a c-Fos‒c-Jun heterodimerek és a c-Fos homodimerek disszociációs állandóját élő sejtekben. Emellett kidolgoztunk egy eljárást a fluoreszkáló transzfektált, és nem fluoreszkáló endogén fehérjék abszolút koncentrációjának mérésére élő sejtekben, amely koncentrációkat figyelembe vettük a disszociációs állandók meghatározásánál. | hu_HU |
| dc.description.abstract | The c-Fos and c-Jun transcription factors, members of the activator protein-1 (AP-1) complex, form heterodimers and bind to DNA via a basic leucine zipper, and regulate the cell cycle, apoptosis, differentiation, etc. Purified c-Jun leucine zipper fragments could also form stable homodimers, whereas c-Fos leucine zipper homodimers were found to be much less stable in earlier in vitro studies. The importance of c-Fos overexpression in tumors and the controversy in the literature concerning c-Fos homodimerization prompted us to investigate Fos homodimerization. FRET and molecular brightness analysis of fluorescence correlation spectroscopy data from live HeLa cells transfected with fluorescent protein-tagged c-Fos indicated that c-Fos formed homodimers. We developed a method to determine the absolute concentrations of transfected and endogenous c-Fos and c-Jun, which allowed us to determine dissociation constants of c-Fos homodimers (Kd=6.7±1.7 μM) and c-Fos–c-Jun heterodimers (on the order of 10-100 nM) from FRET titrations. Imaging fluorescence cross-correlation spectroscopy and molecular modeling simulations confirmed that c-Fos homodimers were stably associated and could bind to the chromatin. Our results establish c-Fos homodimers as a novel form of the AP-1 complex, which may be an autonomous transcription factor in c-Fos overexpressing tissues, and could contribute to tumor development. | hu_HU |
| dc.description.corrector | NE | |
| dc.format.extent | 87 | hu_HU |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/2437/219936 | |
| dc.language.iso | hu | hu_HU |
| dc.language.iso | en | hu_HU |
| dc.subject | Fos homodimerizáció | hu_HU |
| dc.subject | Fos homodimerisation | hu_HU |
| dc.subject | transzkripciós faktor | |
| dc.subject | disszociációs állandó | |
| dc.subject | fluoreszcencia rezonancia energia transzfer | |
| dc.subject | konfokális mikroszkópia | |
| dc.subject | áramlási citometria | |
| dc.subject | fluoreszcencia korrelációs spektroszkópia | |
| dc.subject | lézer pásztázó citométer | |
| dc.subject | transcription factor | |
| dc.subject | dissociation constant | |
| dc.subject | fluorescence resonance energy transfer | |
| dc.subject | confocal microscopy | |
| dc.subject | flow cytometry | |
| dc.subject | fluorescence correlation spectroscopy | |
| dc.subject | laser scanning cytometer | |
| dc.subject.discipline | Elméleti orvostudományok | hu |
| dc.subject.sciencefield | Orvostudományok | hu |
| dc.title | c-Fos transzkripciós faktor hetero- és homodimerizációjának kvantitatív vizsgálata élő HeLa sejtekben | hu_HU |
| dc.title.translated | Quantitative examination of hetero- and homodimerization of c-Fos transcription factor in live HeLa cells | hu_HU |
| dc.type | PhD, doktori értekezés | hu |
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
1 - 4 (Összesen 4)
Betöltés ...
- Név:
- Szaloki_Nikoletta_ertekezes_titkositott.pdf
- Méret:
- 3.51 MB
- Formátum:
- Adobe Portable Document Format
- Leírás:
- Értekezés
Betöltés ...
- Név:
- Szaloki_Nikoletta_meghivo.pdf
- Méret:
- 165.64 KB
- Formátum:
- Adobe Portable Document Format
- Leírás:
- Meghívó
Betöltés ...
- Név:
- Szaloki_Nikoletta_tezis_magyar_titkositott.pdf
- Méret:
- 533.02 KB
- Formátum:
- Adobe Portable Document Format
- Leírás:
- Tézis
Betöltés ...
- Név:
- Szaloki_Nikoletta_tezis_angol_titkositott.pdf
- Méret:
- 500.46 KB
- Formátum:
- Adobe Portable Document Format
- Leírás:
- Short_thesis
Engedélyek köteg
1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
- Név:
- license.txt
- Méret:
- 1.93 KB
- Formátum:
- Item-specific license agreed upon to submission
- Leírás: