A sokoldalú transzglutamináz 2 és a HUVEC sejtek RNS-kötő fehérjéinek kapcsolata

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorKirály, Róbert
dc.contributor.advisorCsaholczi, Bianka
dc.contributor.advisordeptÁltalános Orvostudományi Kar::Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet
dc.contributor.authorCsuth, Anna Renáta
dc.contributor.departmentDE--Általános Orvostudományi Kar
dc.date.accessioned2024-05-22T13:43:12Z
dc.date.available2024-05-22T13:43:12Z
dc.date.created2024
dc.description.abstractA transzglutamináz 2 (TG2) egyedülállóan sokoldalú fehérje. Többféle változatos katalitikus aktivitással rendelkezik, pl. transzglutamináz, PDI, GTPáz, protein kináz aktivitások, és mint interakciós partner többféle biológiai folyamatban is rész vehet. A humán köldökzsinór véna endotél sejtekben (HUVEC) fiziológiásan nagy mennyiségben megtalálható a fehérje, de szerepe az endotél sejtek funkcióiban, az érképzésben részletesen nem ismert. A TG2 interakciós partnereket kétféle koimmunprecipitációt követő LC-MS/MS analízissel azonosítottunk. A STRING analízis alapján, az „RNS-kötés” Gén Ontológia (GO) Molekuláris funkció dúsult a legnagyobb mértékben az interakciós partnerek között. Ez azt sugallja, hogy a TG2 fehérjének szerepe lehet az RNS-kötő fehérjék szabályozásában. Emiatt célul tűztük ki a HUVEC sejtek RNS-kötő fehérjéinek meghatározását és a TG2 interakciós partnerekkel való összehasonlítását. Az élő HUVEC sejtekben UV besugárzással stabilizáltuk az RNS-fehérje komplexeket és ezt követően ortogonális szerves fázis szeparációs eljárással izoláltuk az RNS kötő fehérjéket, amelyeket LC-MS/MS analízissel azonosítottunk. A találatok tanulmányozása során kiderült, hogy a korábban azonosított TG2 interakciós partnerek fele szerepel a HUVEC RNS-kötő fehérjéi között. A HUVEC sejtekből izolált RNS-kötő fehérjék között azonosítottuk a TG2 fehérjét, amit Western blottal is megerősítettünk. Ezután mágneses RNS-fehérje pull-down kisérlettel, egy 43-mer 3’-biotinilált RNS oligonukleotidot immobilizálva sikerült kimutatnunk, hogy a tisztított rekombináns TG2 fehérje képes kötődni az RNS molekulához. Eredményeink alapján a TG2 rendelkezik egy eddig nem publikált RNS-kötő sajátsággal, aminek a részletes karakterizálása folyamatban van.
dc.description.courseorvosi diagnosztikai analitikus
dc.description.courseactnappali
dc.description.courselangmagyar
dc.description.coursespecOrvosi kutatólaboratóriumi analitika
dc.description.degreeBSc/BA
dc.format.extent42
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/2437/370156
dc.language.isohu
dc.rights.accessHozzáférhető a 2022 decemberi felsőoktatási törvénymódosítás értelmében.
dc.subjecttranszglutamináz 2, rns-kötő fehérjék, interakciós partnerek
dc.subject.dspaceOrvostudomány
dc.titleA sokoldalú transzglutamináz 2 és a HUVEC sejtek RNS-kötő fehérjéinek kapcsolata
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
CsA_TG2_palyamunka_.pdf
Méret:
2.47 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Megjelenítés
Engedélyek köteg
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
license.txt
Méret:
2.35 KB
Formátum:
Item-specific license agreed upon to submission
Leírás:
Letöltés
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Általános Orvostudományi Kar)