Kromoszómális R-hurkok a térbeli genomszerkezetben

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorSzékvölgyi, Lóránt
dc.contributor.advisorKarányi, Zsolt
dc.contributor.advisordeptDebreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézethu_HU
dc.contributor.authorBogár, Anita
dc.contributor.departmentDE--Általános Orvostudományi Karhu_HU
dc.contributor.opponentKókai, Endre
dc.contributor.opponentdeptDebreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Orvosi Vegytani Intézethu_HU
dc.date.accessioned2019-06-18T15:18:44Z
dc.date.available2019-06-18T15:18:44Z
dc.date.created2019
dc.description.abstractAz irodalmi adatok alapján az Nodulin homeobox (Ndx) fehérje egy R-hurok szabályozó fehérje az FLC gén területén, amely specifikusan kötődik az R-hurok szimplaszálú DNS-éhez és stabilizálja a struktúrát. Az Ndx fehérje és R-hurkok kapcsolatát vizsgáltuk a genomon belül, melyet a lúdfű genom újgenerációs szekvenálási módszerekkel való vizsgálatával érünk el. A lúdfű genom DRIP-seq és ChIP-seq vizsgálatával nem találtunk egyértelmű bizonyítékot az Ndx fehérje és az R-hurkok kapcsolatára, így kísérleteinkben az Arabidopsis genom 3D vizsgálatával térben feltérképeztük a lehetséges intra- és interkromoszómális kapcsolatokat, melyet Hi-C (genom konformáció leképezés) segítségével végeztünk el. Ezután térstatisztikai módszerekkel megvizsgáltuk, hogy az R-hurkok elhelyezkedése a genomban eltér-e a véletlen eloszlástól, illetve bizonyos helyeken előfordulásuk gyakoribb-e más régióhoz és az Ndx fehérje kötőhelyeihez képest.hu_HU
dc.description.coursemolekuláris biológiahu_HU
dc.description.courseactnappalihu_HU
dc.description.courselangmagyarhu_HU
dc.description.coursespecBiokémia-genomikahu_HU
dc.description.degreeMSc/MAhu_HU
dc.format.extent30hu_HU
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2437/269878
dc.language.isohuhu_HU
dc.subjectR-hurokhu_HU
dc.subjectHi-Chu_HU
dc.subjectArabidopsis thalianahu_HU
dc.subjectNodulin homeoboxhu_HU
dc.subject.dspaceDEENK Témalista::Biológiai tudományok::Molekuláris biológiahu_HU
dc.titleKromoszómális R-hurkok a térbeli genomszerkezetbenhu_HU
dc.title.translatedChromosomal R-loops in the 3D genome structurehu_HU
Fájlok
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Általános Orvostudományi Kar)