A csökkent nyáltermeléssel összefüggő szájnyálkahártya eltérések mikrobiomjának vizsgálata

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorSzarka, Krisztina Zsuzsanna
dc.contributor.advisordeptEgészségtudományi Kar
dc.contributor.advisordeptMetagenomikai Intézet
dc.contributor.authorMolnár, Zsófia
dc.contributor.departmentDE--Általános Orvostudományi Kar
dc.contributor.opponentA TDT elnökség által kijelölt 2 titkos bíráló
dc.contributor.opponentdeptÁltalános Orvostudományi Kar
dc.date.accessioned2026-01-09T10:54:39Z
dc.date.available2026-01-09T10:54:39Z
dc.date.created2025-02-28
dc.description.abstractA legfrissebb tanulmányok szerint a mikrobiom, és a szervezet állapota között szoros összefüggés van. Az orális mikrobiom összetétele és abban bekövetkező változások indikátorai lehetnek a szájnyálkahártya elváltozásoknak. Jelen tanulmány célja a mikrobiális szájflóra diverzitásának és szerkezetének vizsgálata, mely négy betegcsoportra terjedt ki, mint a xerostomia (n=20), hyposalivatio (n=12), az Sjögren-szindróma (n=6), a Bechterew (n=4), valamint a kontroll (n=15) és 57 mintát tartalmazott. A mikrobiális közösségek profilozását 16S rDNS alapú metabarcoding eljárással végeztük. A szekvenálás Oxford Nanopore (ONP) technológia alkalmazásával történt. A szekvenálás során keletkezett adatok bioinformatikai-statisztikai módszerekkel kerültek kiértékelésre. Az ONP technológiával generált adatok hibaszázaléka relatíve magas, így kifejezetten erre a célra fejlesztett EMU szoftvert alkalmaztunk, mellyel meg tudtuk határozni a minták mikrobiális összetételét faj szinten. A törzsszintű relatív abundancia elemzés azt mutatta, hogy a kontroll, a hyposalivált és a xerostomia csoport mikrobiális összetétele hasonló, amelyet a Proteobacteria és a Firmicutes törzsek dominanciája jellemez, míg az Actinobacteria, a Bacteroidetes és a Fusobacteria törzsek alacsonyabb gyakorisággal vannak jelen, minimális eltérést mutatva a csoportok között. Az alfa-diverzitást a Shannon- és Simpson-indexek alapján mérve nem tapasztaltunk szignifikáns különbségeket a csoportok között. A béta-diverzitás Aitchison-távolságon alapuló elemzése a PCoA-ábrákon eltérő klasztereződési mintázatokat mutatott a kontrollcsoport, a hyposalivatio és xerostomia páciensek között genus szinten. A PERMANOVA teszt szignifikáns különbségeket igazolt a kontrollcsoport, illetve a hyposalivatio és xerostomia csoportok között (p <0,05). A törzsszintű eloszlásban megfigyelhető eltérések voltak az egyes minták között a kontroll és a hyposalivatio csoport, valamint a kontroll és a xerostomia csoport között is; ugyanakkor a csoporton belüli diverzitási értékek variabilitása viszonylag magas volt, különösen a patológiás állapotokban. Az ALDEx2 szoftverrel végzett differenciális abundancia elemzés mutatott szignifikáns, statisztikailag megbízható változásokat a mikrobiális összetételben. Az alacsony mintaszám korlátozta a szájüregi mikrobióta diverzitásának és összetételének statisztikai megbízhatóságát; a csökkent nyáltermeléssel összefüggő mikrobiális változások pontosabb feltárásához további, nagyobb mintaszámú vizsgálatok szükségesek.
dc.description.coursemolekuláris biológia
dc.description.courseactnappali
dc.description.courselangmagyar
dc.description.coursespecImmunológia, sejt- és mikrobiológia
dc.description.degreeMSc/MA
dc.format.extent35
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/2437/401868
dc.language.isohu
dc.rights.infoHozzáférhető a 2022 decemberi felsőoktatási törvénymódosítás értelmében.
dc.subjectorális mikrobiom
dc.subjectxerostomia
dc.subjecthyposalivatio
dc.subjectSjögren-szindróma
dc.subject16S rRNS long-read szekvenálás
dc.subject.dspaceOrvostudomány
dc.subject.dspaceBiológiai tudományok
dc.titleA csökkent nyáltermeléssel összefüggő szájnyálkahártya eltérések mikrobiomjának vizsgálata
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 2 (Összesen 2)
Nincs kép
Név:
Molnar_Zsofia_Palyamunka_2025.pdf
Méret:
1.04 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Megjelenítés
Nincs kép
Név:
2025_02_28_878_molnar_zsofia_plagiarism_statement.pdf
Méret:
386.99 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Megjelenítés
Engedélyek köteg
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
license.txt
Méret:
2.35 KB
Formátum:
Item-specific license agreed upon to submission
Leírás:
Letöltés
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Általános Orvostudományi Kar)