A PEO1 és A2780 humán ovárium sejtvonalak miRNS mintázatának összehasonlítása
Fájlok
Dátum
Szerzők
Folyóirat címe
Folyóirat ISSN
Kötet címe (évfolyam száma)
Kiadó
Absztrakt
A petefészekrák a nőgyógyászati daganatok legsúlyosabb formája, melynek hajlamosító tényezői között szerepel az ösztrogéneknek való kitettség. Az ösztrogén válasz szabályozásában meghatározó a miRNS-ek szerepe, melyek a tumorok növekedésében és terjedésében közreműködő kis, nem-kódoló RNS molekulák. Korábbi vizsgálatainkban az ösztrogénkezelésre érzékeny, és nem érzékeny ovárium sejtek miRNS mintázata nagymértékben különbözött. Munkánk célja ezen jelenség hátterének megértése.
Vizsgálatainkhoz a PEO1 (ösztrogén receptor α [ERα] pozitív, ösztrogén érzékeny) és A2780 (ERα negatív, nem ösztrogén érzékeny) humán epiteliális ovárium sejtvonalakat alkalmaztuk. A 2 sejtvonal globális miRNS mintázatát miRNS szekvenálással hasonlítottuk össze (Illumina Nextseq500). Az azonosított miRNS-eket bioinformatikai analízisnek vettettük alá az iDEP és miRNet alkalmazások felhasználásával. Ezt követően 19 miRNS expresszióját qPCR-rel is meghatároztuk.
Eredményeink alapján a PEO1 sejtvonalban 262, az A2780-ban pedig 255 miRNS rendelkezett számottevő expresszióval (FPKM≥1). Ezek közül 186 expresszálódott mindkét sejtvonalban. Az expresszió mértékében való eltérést log 2 FC értékekkel jellemeztük, mely alapján 102 miRNS mutatott magasabb expressziót a PEO1 és 106 miRNS az A2780 esetében (log 2 FC>1). Az expresszióban leginkább eltérést mutató, TOP20 miRNS mindkét sejtvonalban kiterjedt hálózatok kialakítására volt képes, melyben kiemelkedő szerep juthat a let-7b-5p-nek (PEO1) és a miR-1-3p-nek (A2780). A géndúsulási analízis alapján target génjeik számos, a sejtciklushoz, sejthalálhoz, valamint a szteroid hormonok hatásmechanizmusához köthető folyamatokban is dúsulást mutattak. A validálásra kiválasztott 19 miRNS qPCR-rel meghatározott expressziója jól korrelált a szekvenálási adatokkal (r=0,92).
Sikerült több miRNS-t azonosítanunk, amelyek nagyobb expresszióval rendelkeznek az ösztrogén érzékeny PEO1 sejtvonalban. Ezek további vizsgálata hozzájárulhat az ovárium sejtek ösztrogén válaszának megértéséhez, valamint az ovárium tumorok ösztrogén érzékenységének diagnosztizálását lehetővé tevő biomarkerek azonosításához.