Szájüreg mikrobiom bioinformatikai és biostatisztikai elemzése 16S rRNS gén Nanopore szekvenálási adatok alapján

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorVáradi, Alex
dc.contributor.authorKrekács , Ákos
dc.contributor.departmentDE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biotechnológiai Intézet
dc.date.accessioned2025-06-27T10:40:05Z
dc.date.available2025-06-27T10:40:05Z
dc.date.created2025-05-09
dc.description.abstractA mikrobiomkutatás napjaink egyik legfontosabb tudományos irányvonala. Szakdolgozatomban az orális mikrobióta összetételét és annak eltéréseit vizsgáltam egészséges kontroll, valamint xerostomia és hyposalivatio betegcsoportokban. Összesen 53 szájnyálkahártya-mintából izolált teljes hosszúságú 16S rRNS gén amplikont szekvenáltunk Oxford Nanopore MinION platformon, majd az Emu szoftverrel fajszintű taxonómiai besorolást végeztünk. Az alfa-diverzitást Shannon- és Simpson-indexszel, a béta-diverzitást CLR-transzformált euklideszi távolság és PCoA alapú PERMANOVA/PERMDISP tesztekkel vizsgáltuk. Eredményeink szerint a xerostomiás csoport mikrobiótája szignifikánsan elkülönült a kontrollétól (p<0.001), míg a hyposalivatio és kontroll csoportok közötti különbség mérsékelt, de szignifikáns volt (p<0,05). Ezek az eredmények hozzájárulnak a szájszárazság mikrobiótára gyakorolt hatásának megértéséhez, és megalapozzák a jövőbeni, helyspecifikus és longitudinális vizsgálatokat.
dc.description.courseBiotechnológia
dc.description.degreeBSc/BA
dc.format.extent39
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/2437/394889
dc.language.isohu
dc.rights.infoHozzáférhető a 2022 decemberi felsőoktatási törvénymódosítás értelmében.
dc.subjectOrális mikrobiom
dc.subjectOxford NanoPore szekvenálás
dc.subject16S rRNS gén
dc.subjectBioinformatikai elemzés
dc.subjectBiostatisztikai elemzés
dc.subject.dspaceBiológiai tudományok::Mikrobiológia
dc.titleSzájüreg mikrobiom bioinformatikai és biostatisztikai elemzése 16S rRNS gén Nanopore szekvenálási adatok alapján
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
Krekács_Ákos_A426IA_Szakdolgozat.pdf
Méret:
1.53 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Megjelenítés
Engedélyek köteg
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
license.txt
Méret:
2.35 KB
Formátum:
Item-specific license agreed upon to submission
Leírás:
Letöltés
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Biotechnológiai Intézet)