A transzglutamináz 2 gén transzkripciójának szabályozása egér timocitákban
dc.contributor.advisor | Szondy, Zsuzsa | |
dc.contributor.advisordept | Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar | hu_HU |
dc.contributor.advisordept | Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet | hu_HU |
dc.contributor.author | Kovács, Fruzsina | |
dc.contributor.department | DE--Általános Orvostudományi Kar | hu_HU |
dc.contributor.opponent | Kókai, Endre | |
dc.contributor.opponentdept | Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar | hu_HU |
dc.contributor.opponentdept | Orvosi Vegytani Intézet | hu_HU |
dc.date.accessioned | 2018-06-21T09:50:58Z | |
dc.date.available | 2018-06-21T09:50:58Z | |
dc.date.created | 2018 | |
dc.description.abstract | A transzglutamináz 2 egy multifunkcionális fehérje, amely számos biológiai folyamatban vesz részt, így a fejlődő timociták apoptózis programjában is. Laboratóriumunkban korábban kimutatták, hogy az in vivo körülmények között elhaló timocitákban indukálódik a transzglutamináz 2 gén expressziója, viszont in vitro körülmények között nem. Ez a megfigyelés csak úgy magyarázható, hogy az elhaló timociták a szöveti környezetből kapnak olyan szignálokat, amelyek hatására indukálódik bennük a transzglutamináz 2 expresszió. Későbbi vizsgálatok kimutatták, hogy a timociták környezetében megtalálható, a már elhalt sejteket fagocitáló makrofágok által kibocsájtott retinoidok, adenozin és TGFβ vesz részt a Tgm2 indukciójában, ezért kísérleteink során e három szignál jelpályáját vizsgáltuk a Tgm2 kifejeződésének szabályozásában. Korábban publikusan elérhető DNázI-szek és ChIP-szek adatok alapján 5 lehetséges cisz-regulációs elemet találtunk a Tgm2 gén környezetében, amelyekről sikerült enhanszer RNS méréssel igazolni, hogy valóban szerepet játszanak az általunk alkalmazott szignálok hatására a gén szabályozásában. Ezek az enhanszerek a Tgm2 transzkripciós startpontjától +30 kb-ra, -7.9 kb-ra, -13 kb-ra, -20 kb-ra és -28 kb-ra helyezkednek el. Diplomamunkám során az általunk alkalmazott szignálokat közvetítő transzkripciós faktorok, valamint koaktivátorok feldúsulását vizsgáltuk kromatin immunprecipitáció technikával az előzőleg megállapított enhanszereken. A vizsgált transzkripciós faktorok az RXR, a CREB, a SMAD4, a koaktivátorok pedig a P300 és a CBP voltak. Kísérleteink során azt tapasztaltuk, hogy a 9-cisz retinsavra aktiválódó RXR és a mindhárom szignálra reagáló CREB kötődése mindegyik vizsgált enhanszeren megtörténik, míg a TGFβ-ra aktiválódó SMAD4 csak kettőhöz kötődik a vizsgált enhanszerek közül. Továbbá a szignálok kombinált alkalmazásával azt is sikerült kimutatnunk, hogy a retinoid- és TGFβ mediált útvonalak szinergizálnak a -7,9 kb, -13 kb és -20 kb enhanszer régiókon. Eredményeink további részletekkel gazdagítják az egér timocitákban apoptózis során indukálódó Tgm2 gén szabályozásáról meglévő ismereteinket. | hu_HU |
dc.description.course | molekuláris biológia | hu_HU |
dc.description.courseact | nappali | hu_HU |
dc.description.courselang | magyar | hu_HU |
dc.description.coursespec | Biokémia-genomika | hu_HU |
dc.description.degree | MSc/MA | hu_HU |
dc.format.extent | 33 | hu_HU |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/2437/255198 | |
dc.language.iso | hu | hu_HU |
dc.subject | Enhanszer | hu_HU |
dc.subject | ChIP | hu_HU |
dc.subject | Transzkripciós faktorok | hu_HU |
dc.subject.dspace | DEENK Témalista::Orvostudomány | hu_HU |
dc.title | A transzglutamináz 2 gén transzkripciójának szabályozása egér timocitákban | hu_HU |