LPS hatására aktiválódó transzkripciós faktorok vizsgálata egér csontvelő eredetű makrofágokban

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorNagy, Gergely
dc.contributor.advisordeptÁltalános Orvostudományi Kar::Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet
dc.contributor.authorRadócz, Panna Eszter
dc.contributor.departmentDE--Általános Orvostudományi Kar
dc.contributor.opponentSzékvölgyi, Lóránt
dc.contributor.opponentdeptGyógyszerésztudományi Kar
dc.date.accessioned2025-05-21T14:06:50Z
dc.date.available2025-05-21T14:06:50Z
dc.date.created2025
dc.description.abstractA makrofágok kulcsszerepet játszanak az immunválaszok szabályozásában, különösen a lipopoliszacharid (LPS) által kiváltott gyulladásos folyamatokban. A diplomamunkám célja az LPS-indukált transzkripciós faktorok aktivációjának és a kromatinállapot dinamikus változásainak feltérképezése egér csontvelő eredetű makrofágokban. Nyilvánosan elérhető ATAC-seq és ChIP-seq adatok elemzésével vizsgáltuk a kromatin hozzáférhetőségét és a transzkripciós faktorok genomi kötődését több időpontban (0h, 0.5h, 1h, 2h, 4h) az LPS- kezelés hatására. Az ATAC-seq adatok segítségével azonosítottuk a nyitott kromatin régiókat, míg a ChIP-seq adatokból a specifikus transzkripciós faktorok kötődési helyei derültek ki. A két adatforrás integrálásával megállapítottuk, hogy az LPS indukálta transzkripciós faktorok (pl. NF-κB, IRF, AP-1) kötődése összefügg a kromatin nyitottságával, ami aktív génszabályozó mechanizmusokra utal. Klaszterezéssel elkülönítettük a promóterhez közeli és távoli enhanszer-szerű régiókat, majd motívumkereséssel azonosítottuk a klaszter-specifikus transzkripciós faktor kötőhelyeket. Eredményeink hozzájárulnak az LPS által kiváltott gyulladásos válasz molekuláris mechanizmusainak mélyebb megértéséhez.
dc.description.coursemolekuláris biológia
dc.description.courseactnappali
dc.description.courselangmagyar
dc.description.coursespecBiokémia-genomika
dc.description.degreeMSc/MA
dc.format.extent62
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/2437/390216
dc.language.isohu
dc.rights.infoHozzáférhető a 2022 decemberi felsőoktatási törvénymódosítás értelmében.
dc.subjectmakrofág
dc.subjectLPS
dc.subjectbioinformatika
dc.subjecttranszkripciós faktorok
dc.subject.dspaceBiológiai tudományok
dc.titleLPS hatására aktiválódó transzkripciós faktorok vizsgálata egér csontvelő eredetű makrofágokban
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
LPS hatására aktiválódó transzkripciós faktorok vizsgálata egér csontvelő eredetű makrofágokban.pdf
Méret:
2.83 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Megjelenítés
Engedélyek köteg
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
license.txt
Méret:
2.35 KB
Formátum:
Item-specific license agreed upon to submission
Leírás:
Letöltés
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Általános Orvostudományi Kar)