Digitális mikroszkópia és képelemző technikák a fonalasgombák patogenitásának vizsgálatában

dc.contributor.advisorSzemán-Nagy, Gábor György
dc.contributor.authorTálas, László
dc.contributor.authorvariantTálas, László
dc.contributor.departmentJuhász-Nagy Pál doktori iskolahu
dc.contributor.submitterdepDE--Természettudományi és Technológiai Kar -- Molekuláris Biotechnológiai és Mikrobiológiai Tanszék
dc.date.accessioned2019-03-09T07:13:57Z
dc.date.available2019-03-09T07:13:57Z
dc.date.created2019hu_HU
dc.date.defended2019-03-04
dc.description.abstractAz invazív gombák micéliális morfológiai változásainak vizsgálata elengedhetetlen a fonalas gombák patogenitásának mélyebb megértésében. Egyrészt ez hasznos ipari szempontból, mivel a micéliális folyamatok bizonyos típusai összefüggésben vannak az ipari fermentációk termelékenységével, másrészt orvosbiológiai szempontból is fontos, mivel az invazív gombás megbetegedések egyre gyakoribbak és halálos fertőzéseket is okoznak immunhiányos betegekben. A morfológiai változások kvalitatív és kvantitatív dinamikai paramétereinek meghatározása azonban továbbra is jelentős kihívást jelent a tudomány jelenlegi eszközeivel. A spórák letapadási dinamikájának pontosabb megismerése lehetőséget biztosíthat a fermentációs rendszerek termelékenységének növelésére, illetve az invazív gombás megbetegedések elleni védekezésre. A statikus és dinamikus képelemző technikák felhasználhatók olyan gombapopulációk vizsgálatára is, melyekben az egyedi spórák jelentősége nő meg a tenyésztési ciklus alatt és ezek kitapadási és/vagy spórázási dinamikája követhető. Megfelelő időbeli felbontás mellett a hosszú távú videómikroszkópos vizsgálatok segítségével definiált mikrobiológiai paraméterek valós időben és hosszú távon vizsgálhatók. Ilyen paraméterek a spóranövekedés, letapadás, osztódás, biofilm képződés, konfluencia, motilitás. Optimális esetben ezek a paraméterek a megfigyelés teljes időtartama alatt követhetőek és ez által összefüggéseikben is vizsgálhatóak lesznek. A videómikroszkópos rendszer által készített felvételek feldolgozása során nyert adatok specifikusan adaptált dinamikus képanalízisét alkalmazva, egy vizsgált osztódási vagy szaporodási szakasz pontosabban modellezhetővé válhat. A képanalízis során kvalitatív és kvantitatív szempontok szerint is tanulmányozhatjuk az egyes folyamatokat. A videómikroszkópia egy olyan, hosszú ideig (hetekig) folytatható monitoring-módszer, amelyet a célszerűen kiválasztott digitális képelemzéssel és adatfeldolgozással kombinálva olyan kísérleti elrendezést kapunk melynek fő előnye, hogy a változások időbeli lefutása dinamikusan vizsgálhatóvá, illetve modellezhetővé válik, így hűen tükrözi az időben lezajló folyamatokat. In order to get a deeper understanding of the pathogenicity of filamentous fungi it is necessary to examine the mycelial morphological changes of invasive fungal species. It is, on the one hand, important from an industrial point of view, as certain types of mycelial processes may affect the productivity of industrial fermentation, while on the other hand it is also important from a medical point of view, because the number of patients with invasive fungal diseases is on the rise, and some fungi can even cause lethal infections in immunocompromised patients. However, the determination of qualitative and quantitative dynamic parameters of morphological changes still represents a major challenge due to the limitations of our tools. A deeper understanding of the dynamics of spore adherence may help us increase the productivity of fermentation systems and fight against invasive fungal diseases. Static and dynamic image analysis techniques can also be used for studying fungal populations in which the significance of individual spores grows during the growth phase, and their adherence and/or germination dynamics can be observed. With an appropriate temporal resolution, microbiological parameters defined with the help of long-term video microscopy can be studied real time and over a longer period. Such parameters include spore growth, adherence, division, appearance of biofilm, confluence, and motility. Optimally, these parameters can be monitored throughout the entire observation, which allows us to study their interrelations as well. The specially adapted dynamic image analysis of data collected through processing images captured by the video microscopy system may allow us to model a specific division or reproduction phase more accurately. In the course of image analysis we can study individual processes based on qualitative and quantitative aspects as well. Video microscopy is a long-term (up to weeks) monitoring system that, when combined with carefully chosen digital image analysis and data processing, results in an experimental setup, the main advantage of which is that it allows us to study and model the dynamics of changes in time, providing us with a real or actual picture of temporal changes.hu_HU
dc.description.correctorNE
dc.format.extent110hu_HU
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2437/264286
dc.language.isohuhu_HU
dc.subjectPatogenitáshu_HU
dc.subjectLetapadás
dc.subjectTime-Lapse mikroszkópia
dc.subjectCandida
dc.subjectAspergillus
dc.subject.sciencefieldTermészettudományokhu
dc.titleDigitális mikroszkópia és képelemző technikák a fonalasgombák patogenitásának vizsgálatábanhu_HU
dc.title.translatedDigital microscopy and image analysis techniques for pathogenicity of filamentous fungihu_HU
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 2 (Összesen 2)
Nem elérhető
Név:
DOKTORI2019.pdf
Méret:
3.31 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Doktori értekezés
Nem elérhető
Név:
Talas_Laszlo_Doktori_tezis.pdf
Méret:
1.4 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Doktori Tézis magyar és angol nyelven
Engedélyek köteg
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nem elérhető
Név:
license.txt
Méret:
1.93 KB
Formátum:
Item-specific license agreed upon to submission
Leírás: