Genom-konzerváltság és szekvencia divergencia kapcsolatának vizsgálata három Ascomycota modell nemzetség felhasználásával

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorÁcs-Szabó, Lajos
dc.contributor.authorGucsik, Bence
dc.contributor.departmentDE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biotechnológiai Intézet
dc.date.accessioned2023-05-05T06:36:13Z
dc.date.available2023-05-05T06:36:13Z
dc.date.created2023-05-04
dc.description.abstractA gombák az eukarióták egyik népes csoportját (királyságát) alkotják, amelyek jelentősen eltérnek mind az állatoktól, mind a növényektől. A magasabb rendű eukariótákhoz mérten kis és kompakt genomokkal rendelkeznek, mindemelett számos gombafajt könnyű szaporíthatósága és rövid generációs ideje miatt a laboratóriumi alapkutatások fő modelljeiként tartanak számon. Az NCBI adatbázisa szerint a legtöbb megszekvenált eukarióta genom is a gombák közül került ki. Habár életfolyamataikat tekintve jelentősen eltérnek a többi eukarióta élőlénytől, a velük végzett vizsgálatok nagy mértékben hozzájárulnak az alapvető molekuláris folyamatok megértéséhez napjainkban is. A rendelkezésre álló nagy számú teljes genom szekvencia lehetővé teszi azonban az evolúciós léptékű jelenségek vizsgálatát is. Számos tanulmány született, amely a gombák filogenezisével, genomevolúciójával foglalkozik, amelyek lehetővé tették számos trend és jelenség megismerését, megértését. Jelen diplomadolgozat alanyai szintén gombák, az Aszkomikóta altörzs három nemzetségének (hasadó élesztő, sarjadzó élesztő és fonalas gomba) négy-négy faja. E modellnemzetségeket felhasználva górcső alá kerül a fajok genom-konzerváltságának és szekvencia divergenciájának mértéke, illetve ezek kapcsolatai. Diplomadolgozatomban a következő célkitűzéseket kívántam megvalósítani: - a vizsgált genomok legkevésbé változékony régióit feltárni, majd ezek segítségével a genom-konzerváltság mértékét meghatározni - statisztikai módszerekkel a konzervált genom-szegmensek tulajdonságait összehasonlítani - feltételezett ortológ szekvenciákat azonosítani, segítségükkel a szekvencia-divergencia mértékét meghatározni - a genom-konzerváltság és a szekvencia-divergencia kapcsolatait feltárni - értékelni a megfigyelt trendeket a különböző nemzetségek vonatkozásában
dc.description.correctorLB
dc.description.courseBiotechnológia MSc
dc.description.degreeMSc/MA
dc.format.extent47 oldal
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/2437/351897
dc.language.isohu
dc.rights.accessHozzáférhető a 2022 decemberi felsőoktatási törvénymódosítás értelmében.
dc.subjectgenom-konzerváltság
dc.subjectbioinformatika
dc.subjectgenomika
dc.subjectszekvencia divergencia
dc.subject.dspaceDEENK Témalista::Biológiai tudományok::Biotechnológia
dc.titleGenom-konzerváltság és szekvencia divergencia kapcsolatának vizsgálata három Ascomycota modell nemzetség felhasználásával
Fájlok
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Biotechnológiai Intézet)