Szerző szerinti böngészés "Farkas, Ilona"
Megjelenítve 1 - 17 (Összesen 17)
Találat egy oldalon
Rendezési lehetőségek
Tétel Korlátozottan hozzáférhető Candida albicans protein foszfatáz Z 1 integrációs vektorkonstrukció készítéseSzabó, Enikő; Farkas, Ilona; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetCandida albicans-ba integrálódó vektorkonstrukció készítése klónozási lépésekkel, segédvektor segítségével.Tétel Korlátozottan hozzáférhető Candida albicans protein foszfatáz Z szerkezet-funkció vizsgálataKerezsi, Bea; Farkas, Ilona; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetSzakdolgozatom témája a Candida albicans egy egy enzimének(CaPpz1)vizsgálata.Választ keresünk többek között arra a kérdésre, hogyan változik a foszfatáz aktivitása a lehetséges fehérjekötő régiók deléciójával in vitro és változik-e funkciója in vivo.A CaPpz1 fehérjét és három deléciós mutánsát GST-fúziós fehérje formájában termeltettem a pGEX-6P-1 vektor segítségével. Fő feladatom a fehérjék expresszálása és tisztítása volt.Valamennyi tisztított fehérjepreparátum alkalmas foszfatáz aktivitásmérésre. A foszfatázok specifikus aktivitásának meghatározása után lehetővé válik, hogy következtetéseket vonjunk le arra vonatkozóan, hogyan hat egy adott peptid régió deléciója az enzim aktivitására in vitro.Tétel Korlátozottan hozzáférhető Candida albicans protein foszfatáz Z1 deléciós mutánsok előállítására alkalmas vektorkonstrukciók készítéseUgóczki, Beatrix; Farkas, Ilona; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetCandida albicans protein foszfatáz Z1 deléciós mutánsok előállítására alkalmas vektorkonstrukciók készítéseTétel Korlátozottan hozzáférhető Dissection of the regulatory role for the N-terminal domain in Candida albicans protein phosphatase Z1(2019) Szabó, Krisztina; Kónya, Zoltán; Erdődi, Ferenc; Farkas, Ilona; Dombrádi, ViktorTétel Korlátozottan hozzáférhető Expression, purification and investigation of retrotransposon-derived PEG10 proteinVadadokhau, Uladzislau; Mótyán, János András; Department of Biochemistry and Molecular Biology; DE--Általános Orvostudományi Kar; Farkas, Ilona; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Orvosi Vegytani IntézetDespite the fact that PEG10 was shown to be involved in placenta, adipose tissue, and cancer formation, it is little known about this protein at a molecular level. Especially, no solid data has been published regarding a retroviral-type aspartic protease of PEG10 so far. Autoproteolytic assay performed in this project implies that PEG10 aspartyl protease is active. Analysis of protease activity became possible due to the expression of the protein in the bacterial system we designed. Preliminary results show that PEG10 may cleave itself at some sites with the formation of cleavage products having different size. The structure and the role of these products are still unrevealed. In addition, the sensitivity of PEG10 aspartic protease to retroviral protease inhibitor makes the design of new inhibitors against PEG10 a striking prospect. Therefore, future research may be aimed to elucidate the role of cleavage products in the PEG10 function with further biochemical characterization of PEG10 activity. Results presented in this work will facilitate the characterization of PEG10 aspartic protease and the role of PEG10 in human biology.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A növényi foszfoprotein foszfatázok működésének vizsgálata(2012-05-02T12:41:51Z) Katona, Frida; Farkas, Ilona; DE--TEK--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA protein foszfatáz 1 (PP1) fontos szerepet tölt be az állatok sejtciklusának szabályozásában, többek között a retinoblasztóma fehérjéket is defoszforilálja. Az Orvosi Vegytani Intézet és az MTA Szegedi Biológiai Központ együttműködésében végzett kísérletek előzetes eredményei szerint a rizs PP1 az egyszikűek sejtciklusának is fontos regulátora, defoszforilálja a retinoblasztóma-szerű fehérjéket. A növényi PP1 szubsztrátjainak azonosításához a rizs PP1 elleni antitestet kívánunk előállítani. Ebből a célból baktériumban termeltettünk rizs PP1 katalitikus alegységet. A rizsben található PP1 katalitikus alegységet kódoló Os01g0349400 gén cDNS-ét pET28a(+) plazmidba ligálva előállítottunk egy hexahisztidin-fúziós fehérje termeltetésére alkalmas bakteriális vektort. A vektor segítségével E. coli BLR sejtekben rekombináns fehérjét termeltettünk, amelynek SDS-PAGE segítségével meghatározott molekulatömege jól egyezett a számított molekulatömeggel, és a fúziós peptidszakaszra specifikus antitest segítségével Western blottal detektálható volt. Végezetül a termeltetett hexahisztidin-fúziós fehérjét nikkel-agaróz kromatográfiával csaknem homogén formában nyertük ki. Az eljárással antitest termeltetésére alkalmas, könnyen tisztítható rekombináns rizs PP1c-t tudunk előállítani.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A PPM1L protein foszfatázzal kölcsönható fehérjék vizsgálata emlős sejtekben(2014-05-05T06:12:56Z) Somogyi, Orsolya; Farkas, Ilona; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA rekombináns PPM1L termeltetés baktériumban, olyan címkével, amelynek segítségével a fehérje affinitáskromatográfiásan közvetlenül tisztítható a baktériumsejtek kivonatábólTétel Korlátozottan hozzáférhető A protein foszfatáz 2A B" alegységével kölcsönható fehérjék azonosítása emlős sejtekben(2014-05-05T06:13:41Z) Zara, Bernadett; Farkas, Ilona; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetRekombináns PR48 fehérje expressziója baktériumsejtekben.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A protein foszfatáz 2A kölcsönható fehérjéinek hatása emlős sejtekben(2013-05-09T07:42:47Z) Farkas, Szimonetta; Farkas, Ilona; DE--TEK--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA protein foszfatáz 2A kölcsönható fehérjéinek vizsgálata emlős sejtekben.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A protein foszfatáz 2C kölcsönható fehérjéinek vizsgálata emlős sejtekben(2013-05-09T07:55:21Z) Borza, Máté; Farkas, Ilona; DE--TEK--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA protein foszfatáz 2C kölcsönható fehérjéinek vizsgálata emlős sejtekben.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A protein foszfatáz Z funkciójának vizsgálata mutagenezisselSzabó, Enikő; Farkas, Ilona; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA Candida albicans protein foszfatázának funkcionális vizsgálata mutagenezissel.Tétel Szabadon hozzáférhető Protein phosphatase CaPpz1 is involved in cation homeostasis, cell wall integrity and virulence of Candida albicans(2012) Ádám, Csaba; Erdei, Éva; Casado, Carlos; Kovács, László; Gonzalez, Asier; Majoros, László; Petrényi, Katalin; Bagossi, Péter; Farkas, Ilona; Molnár, Mónika; Pócsi, István; Ariño, Joaquín; Dombrádi, ViktorTétel Korlátozottan hozzáférhető Rizs protein foszfatáz 2 A B'' (PP2A B”) alegységének termeltetése baktériumban(2010-05-07T10:19:31Z) Nótár, Balázs; Farkas, Ilona; DE--TEK--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA protein foszfatáz 2A (PP2A) fontos szerepet játszik az állatok sejtciklusának regulációjában, többek között a retinoblasztóma fehérjék foszforilációs állapotát is szabályozza. A PP2A és a retinoblasztóma-fehérjék homológjai növényekben is megtalálhatók, de funkciójuk sokkal kevésbé ismert, mint az állatokban. A PP2A változó B regulátor alegységei meghatározzák a foszfatáz sejten belüli lokalizációját és szubsztrátspecificitását. A Szegedi Biológiai Központban végzett kísérlet szerint a lucerna PP2A B” alegysége élesztő kéthibrid-rendszerben kölcsönhatásba lép az OsRBR1 retinoblasztóma-homológ rizs fehérjével, így a B” alegységet tartalmazó növényi PP2A holoenzimnek in vivo is szerepe lehet az OsRBR1 defoszforilációjában. Ennek tanulmányozása érdekében a rizs PP2A B” alegységet hexahisztidin-fúziós fehérjeként expresszáltuk E. coli baktériumban, majd Ni2+-agaróz kromatográfiával homogén formában tisztítottuk. A rekombináns fehérje ellen poliklonális ellenanyagot termeltettünk nyúlban. Az antiszérumot affinitás-kromatográfiával tisztítottuk. Az ellenanyagot dot blottal és Western blottal vizsgáltuk. Eredményeink szerint a PP2A B” antitest nemcsak a rekombináns His6-PP2A B” fehérjét ismeri fel, hanem – a Western blottal azonosított protein molekulatömege alapján) a rizs szuszpenziós sejtkivonatban és a levélkivonatban levő PP2A B” fehérjét is. Ennek alapján a továbbiakban felhasználhatjuk az ellenanyagot többek között a PP2A-val kölcsönható fehérjék azonosítására immunprecipitációs kísérletekben.Tétel Korlátozottan hozzáférhető Rizs protein foszfatáz 2A B'' alegység expressziójára alkalmas vektorkonstrukciók készítése(2010-12-06T09:34:42Z) Kállai, Judit; Farkas, Ilona; DE--TEK--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA rizs protein foszfatáz 2A-t vizsgáltuk molekuláris biológiai módszerekkel. Célul tűztük ki a PP2A B'' alegységgel kölcsönható fehérjék tanulmányozását, ami lehetővé teszi a holoenzim szerkezetének vizsgálatát és eddig nem ismert szubsztrátjainak azonosítását. 1. A PP2A B'' alegység elleni antitest előállításához olyan vektorkonstrukciót kívántunk előállítani,amellyel Escherichia coliban a PP2A B'' hexahisztidin-fúziós fehérjeként termeltethető, és affinitáskromatográfiával egyszerűen tisztítható. 2. Olyan növényi expressziós vektorkonstrukciót akartunk létrehozni, amelynek segítségével rizsben legalább két tandem fúziós peptidszakasszal ellátott PP2A B'' expresszálható, és TAP módszerrel (tandem affinity purification) tisztítható a rekombináns PP2A B''-vel in vivo kölcsönható fehérjék komplexe.Tétel Korlátozottan hozzáférhető Rizs retinoblasztóma-homológ fehérjék expressziója baktériumbanGajtkó, Andrea; Farkas, Ilona; DE--TEK--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetElőzetes eredmények szerint a lucerna PP2A B” alegysége élesztő két-hibrid rendszerben specifikus kölcsönhatásba lépett a lucerna és a rizs Rb1 fehérjével (Lendvai és mtsai, 2007). Ennek alapján a rizs retinoblasztóma-homológ fehérje (fehérjék) defoszforilációjában is szerepet játszhat ez az enzim. A retinoblasztóma-homológ fehérjék PP2A-val való defoszforilálhatóságának tanulmányozásához E.coliban termeltettem az Rb1 és Rb2 fehérje C-terminális fragmentjét (Rb1/C és Rb2/C), valamint teljes hosszúságú Rb2-t. A pET-28(+) vektor segítségével hexahisztidin fúziós szakasszal együtt expresszálódtak a retinoblasztóma fehérjék, ami lehetővé tette Ni-agaróz kromatográfiával történő tisztításukat. A tisztított fúziós fehérjéket SDS-poliakrilamid gélelektroforézissel és Western blottal vizsgáltam. Az Rb1/C-t közel homogén formában izoláltam, míg az Rb2/C frakciók valamivel több szennyező fehérjét tartalmaztak. Teljes hosszúságú Rb2-t is sikerült kinyerni a baktériumsejtekből, azonban a tisztított frakciók feltehetően az Rb2 proteolitikus bomlástermékeit is tartalmazták.Tétel Szabadon hozzáférhető The phosphatome of opportunistic pathogen Candida species(2021) Szabó, Krisztina; Miskei, Márton; Farkas, Ilona; Dombrádi, ViktorTétel Korlátozottan hozzáférhető Vektorkonstrukciók Candida albicans protein foszfatáz Z1 pontmutánsok előállításáhozSpisák, Krisztina; Farkas, Ilona; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetSzakdolgozatom témája a CaPPZ1 gén által kódolt Candida albicans protein foszfatáz Z1 (CaPpz1). Ez az enzim gombaspecifikus foszfatáz, amely szabályozza a sejtfal integritását, a kation homeosztázist, a membránpotenciált, az oxidatív stressz választ és a virulenciát. A CaPPZ1 pontmutációjával olyan integrációs Candida vektorokat hoztam létre, melyek segítségével - a CaPPZ1 deléciós Candida mutáns genomjába integrálva - a CaPpz1 enzim az R262L mutáció következtében inaktív formában, illetve a G2A mutáció eredményeként mirisztoilációs hely nélkül termelődik. A létrejövő mutánsok fenotípusából következtethetünk majd a mutációk fiziológiás szerepére.