Áramlási citometriás fret mérések optimalizálása és alkalmazása a majdnem teljes ErbB2 molekula modellezésében

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorSzöllősi, János
dc.contributor.advisorVereb, György
dc.contributor.authorHorváth, Gábor
dc.contributor.departmentDE -- Orvos- és Egészségtudományi Centrum -- Általános Orvostudományi Kar -- Biofizikai és Sejtbiológiai Intézeten
dc.contributor.departmentElméleti orvostudományok doktori iskolahu
dc.date.accessioned2007-05-04T17:29:19Z
dc.date.available2007-05-04T17:29:19Z
dc.date.defended2005-10-11
dc.date.issued2005
dc.descriptionAngol nyelvű cikkeket tartalmazhu
dc.description.abstractMunkánk két fő célja az volt, hogy fluoreszcencia rezonancia energiatranszfer (FRET) alapú epitóp térképezési és molekuláris modellezési eljárásokkal az ErbB2 receptor és dimerjének molekuláris modelljét megszerkesszük, valamint, hogy megállapítsuk újonnan kifejlesztett fluoreszkáló festékek és áramlási citométerek használhatóságát áramlási citometriás FRET (FCET) mérésekben. Vizsgálataink eredményei a következők: • Az általunk vizsgált hét fluoreszkáló festék segítségével megállapítottuk a sejtek felszínén lévő membránfehérjék asszociációjának áramlási citometriás tanulmányozásához nélkülözhetetlen paramétereket, melyek a normalizált fluoreszcencia intenzitás, a transzfer átmenet nagyságára jellemző átfedési integrál (vagy kritikus Förster távolság), a normalizált FRET hatékonyság, valamint a festékek gerjeszthetőségét figyelembe vevő efr együttható. • Az általunk vizsgált három áramlási citométeren azt találtuk, hogy a FCET mérésekhez az Alexa546-Alexa647 és az Alexa555-Cy5 donor-akceptor festékpár optimális. • FCET mérésekben meghatároztuk az ErbB2 receptor különböző epitópjaihoz kötődő, fluoreszkáló festékekkel jelzett antitestek egymástól és a sejtmembrántól való távolságait. • A fenti távolság és irodalmi kristályszerkezeti adatok alapján, molekulamodellezési eljárások segítségével megszerkesztettük a majdnem teljes ErbB2 transzmembrán receptor molekuláris modelljét, amely tartalmazta az extracelluláris domént, a transzmembrán régiót és a tirozinkináz domént, valamint az ezeket összekötő szakaszokat. Az antitesttel jelölt ErbB2 molekulák között mért FRET hatékonyság értékek alapján felállítottunk egy lehetséges modellt az ErbB2 receptor dimerre, amely az EGFR dimerhez hasonló módon kapcsolódott össze, valamint rámutattunk több lehetséges dimerizációs felszínre a külső membránközeli összekötő szakasznál, a transzmembrán, valamint a tirozinkináz régióknál.en
dc.description.bibliographyBibliogr.: p. 61-68hu
dc.description.degreePhDen
dc.format.extent70, [20] pen
dc.format.extent234498 bytes
dc.format.extent177221 bytes
dc.format.extent1303899 bytes
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2437/2167
dc.languagehunhu
dc.languageenhu
dc.language.isohuen
dc.language.isoenen
dc.rightsA kéziratos doktori PhD értekezések, csak a szerzői jogok teljes tiszteletben tartásával használhatókhu
dc.rights.accessno_restrictionen
dc.subject.disciplineElméleti orvostudományokhu
dc.subject.sciencefieldOrvostudományokhu
dc.titleÁramlási citometriás fret mérések optimalizálása és alkalmazása a majdnem teljes ErbB2 molekula modellezésébenen
dc.title.subtitle[doktori (PhD) értekezés]en
dc.title.translatedOptimization of Flow Cytometric FRET Measurements and their Application in the Molecular Modeling of the Nearly Full ErbB2 Receptoren
dc.typePhD, doktori értekezéshu
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 3 (Összesen 3)
Bélyegkép
Név:
Horvath_Gabor_ertekezes.pdf
Méret:
1.24 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Letöltés
Bélyegkép
Név:
Horvath_Gabor_tezis_angol.pdf
Méret:
173.07 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Letöltés
Bélyegkép
Név:
Horvath_Gabor_tezis_magyar.pdf
Méret:
229 KB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Letöltés
Gyűjtemények
Molekuláris Orvostudomány Doktori Iskola