Gombafertőzések molekuláris diagnosztikájának optimalizálása

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorPappné Terhes, Gabriella
dc.contributor.authorNyári, Melitta Éva
dc.contributor.departmentDE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai Intézethu_HU
dc.date.accessioned2024-06-24T10:16:05Z
dc.date.available2024-06-24T10:16:05Z
dc.date.created2024-05-02
dc.description.abstractAz invazív gombafertőzések növekvő incidenciája mellett az újabban megjelenő fajok és a rezisztencia kialakulása is pontos és gyors diagnózist kíván. A magas mortalitás és a kezelési nehézségek ugyancsak indokolják a gombainfekciók korai kimutatását. A PCR technikák jól illeszthetők a diagnosztikai eljárások közé, mivel könnyen kivitelezhetők, valamint áruk csökkenő tendenciát mutat, továbbá gyors és szenzitív megoldást kínálnak. Egy szűrőtesztként alkalmazható, pánfungális PCR optimalizálásán dolgoztunk, melynek keretében két ITS (internal transcribed spacer) alapú és egy 18S rRNS-t kódoló szekvencia alapú primerpárt vizsgáltunk úgy, hogy a már meghatározott anellációs hőmérsékletre optimalizáltuk a primer és MgCl2 koncentrációkat. A vizsgálat során megfigyelhető volt, hogy a különböző gombafajok esetén elterő primer koncentrációk bizonyultak optimálisnak, ezzel szemben a MgCl2 koncentráció nem befolyásolta lényegesen a Ct értéket. Továbbá az ITS alapú, real-time PCR érzékenyebbnek bizonyult a 18S rDNS alapú end point PCR-hez képest. A real-time PCR-ek olvadási görbe analízise során a Tm-ek és az amplifikációs görbék alapján megállapítható volt, hogy az ITS primerpárokat alkalmazva a pánfungális PCR alkalmas lehet egyes genusok elkülönítésére, de pontos genus és fajszintű identifikálás csak szekvenálással lehetséges. Amennyiben az ITS PCR és szekvenálás nem vezetne eredményre, a jövőben a 18S rDNS reakcióelegy módosításával, tenyészetből optimalizálnánk a PCR-t, amelyet szekvenálással egészítenénk ki. Az invazív aspergillosis igazolására a laboratóriumban elérhető primereket alkalmaztuk A. flavus és A. fumigatus vérből történő kimutatására, egy nemzetközi közleményben közölt real-time PCR adaptálásával. A két primerpár közötti jelentős Tm különbség ellenére megpróbáltuk a javasolt reakció körülményeket, melyek az A. fumigatus esetében jelentősen csökkentették az érzékenységet. A vizsgálat további optimalizálást igényel.
dc.description.courseBiológia
dc.description.degreeMSc/MA
dc.format.extent39
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/2437/374836
dc.language.isohu
dc.rights.accessHozzáférhető a 2022 decemberi felsőoktatási törvénymódosítás értelmében.
dc.subjectgombafertőzések, molekuláris, PCR, immunszupprimált
dc.subject.dspaceDEENK Témalista::Biológiai tudományokhu_HU
dc.titleGombafertőzések molekuláris diagnosztikájának optimalizálása
dc.title.translatedOptimalisation of molecular diagnosis of fungal diseases
Fájlok
Eredeti köteg (ORIGINAL bundle)
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
Gombafertőzések molekuláris diagnosztikájának optimalizálása_Nyari Melitta.pdf
Méret:
2.24 MB
Formátum:
Adobe Portable Document Format
Leírás:
Megjelenítés
Engedélyek köteg
Megjelenítve 1 - 1 (Összesen 1)
Nincs kép
Név:
license.txt
Méret:
2.35 KB
Formátum:
Item-specific license agreed upon to submission
Leírás:
Letöltés
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Biológiai és Ökológiai Intézet)