A Drp1 mitokondriális hasadásért felelős fehérje hatása neuroblasztóma sejtek "in vitro" neurális differenciációjára - globális transzkripciós változások "in silico" analízise.

A tétel rövid nézete
dc.contributor.advisorTar, Krisztina
dc.contributor.advisordeptDebreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Orvosi Vegytani Intézet
dc.contributor.authorZöld, Mariann Emese
dc.contributor.departmentDE--Általános Orvostudományi Kar
dc.contributor.opponentBácsi, Attila
dc.contributor.opponentdeptDebreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Immunológiai Intézet
dc.date.accessioned2023-06-02T13:05:37Z
dc.date.available2023-06-02T13:05:37Z
dc.date.created2023
dc.description.abstractA mitokondriumok dinamikus organellumok, amelyek folyamatos fúzión és hasadáson mennek keresztül. Az olyan neurodegeneratív betegségekre, mint például a Huntington kór gyakran jellemző a mitokondriális dinamika felborulása. A Huntington betegségben számos mitokondriális fúzióért és hasadásért felelős fehérje diszregulációját leírták már, például a Drp1 (dynamin-related protein 1), Fis1 (mitochondrial fission 1 protein), Mfn1 (mitofusin 1), Mfn2 (mitofusin 2), OPA1 (optic atrophy protein 1). A laboratóriumban elvégzett kísérlet során a fúziós és a hasadási folyamatban szerepet játszó mitokondriális gének expressziójának változását vizsgáltam egy Drp1-et stabilan csendesített és egy kontroll sejtvonalban. A kísérlethez nem differenciált sejteket használtam és a mitokondriális géneket qPCR-el vizsgáltam. Összesen 8 mitokondriális gént vizsgáltam meg, ezek a következők voltak: OPA1, Mff, MFN2, MFN1, FIS1, MDIV49, MDIV51, DNM1L. Az Mff kivételével ezen gének közül egyik expressziójában sem figyeltem meg változást a Drp1 csendesítés hatására. Az előzetes eredmények arra utalnak, hogy az Mff downregulált, viszont ennek megerősítésére további vizsgálatok szükségesek. Az in silico vizsgálat során nem differenciált, Drp1 csendesített és kontroll sejtvonalon készült RNS szekvenálás eredményét elemeztem. Később a munkacsoport a sejteket retinsavval és BDNF-el (Brain-Derived Neurotrophic Factor) differenciáltatta. A neurális differenciálás első és hatodik napján qPCR-el a következő gének expressziójában bekövetkező változásokat vizsgálták: BANK1, DUSP2, ISLR2, HES7, DEPTOR, ROBO2, DUSP9, INSM1, DRD2, MYCL, GDF-10, NEUROG-2, VEGFA. Az eredmények arra mutattak, hogy a DEPTOR, az ISLR2 és a BANK1 expressziójában szignifikáns változás történt a neurális differenciáció során a Drp1 csendesítés hatására összehasonlítva a differenciált kontrollal. Következtetésként elmondhatjuk, hogy a Drp1 stabil csendesítése a mitokondriális morfológia megváltozását eredményezi. A mitokondrium a Drp1 csendesített sejtek neurális differenciációja során nem rendeződik át és a vizsgált gének expressziója sem mutat szignifikáns eltérést. Ugyanakkor a differenciáció során bizonyos gének expressziója szignifikánsan megváltozik a differenciált kontroll sejtekhez képest.
dc.description.correctorLB
dc.description.coursemolekuláris biológia
dc.description.courseactnappali
dc.description.courselangmagyar
dc.description.coursespecImmunológia, sejt- és mikrobiológia
dc.description.degreeMSc/MA
dc.format.extent34
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/2437/354559
dc.language.isohu
dc.rights.accessHozzáférhető a 2022 decemberi felsőoktatási törvénymódosítás értelmében.
dc.subjectDrp1
dc.subjectmitokondrium
dc.subjectneuroblasztóma
dc.subjectneurális differenciáció
dc.subjectqPCR
dc.subject.dspaceDEENK Témalista::Biológiai tudományok::Molekuláris biológia
dc.titleA Drp1 mitokondriális hasadásért felelős fehérje hatása neuroblasztóma sejtek "in vitro" neurális differenciációjára - globális transzkripciós változások "in silico" analízise.
Fájlok
Gyűjtemények
Hallgatói dolgozatok (Általános Orvostudományi Kar)