Time-lapse imaging rendszerek kvalitatív és kvantitatív elemzése

dc.contributor.advisorSzemán-Nagy, Gábor György
dc.contributor.authorKirály, Gábor
dc.contributor.departmentDE--TEK--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai Intézethu_HU
dc.date.accessioned2011-05-10T13:22:24Z
dc.date.available2011-05-10T13:22:24Z
dc.date.created2011-05-09
dc.date.issued2011-05-10T13:22:24Z
dc.description.abstractVizsgálataim során a Long-Term Scan rendszerrel felvett képek elemzését végeztem, mely rendszer segítségével több sejtciklus alatt nyerünk betekintést a sejtpopulációk életfolyamataiba. A Long-Term Scan rendszer a time-lapse imaging módszert felhasználva előre meghatározott időközönként készíti el a felvételeket a vizsgált sejtekről. Ez a módszer akkor előnyös, ha nincs szükségünk a vizsgálat teljes időtartama alatt az összes képre, hanem csak az egymáshoz képest bizonyos idő elteltével készült képek szükségesek. A rendszerrel rögzített képi adatbázisból matematikai módszerek szoftveres alkalmazásával információkat tudtam kinyerni. A képelemzést a Java nyelven írt ImageJ programmal végeztem, mely ingyenesen letölthető alkalmazás, számos képjavító- és helyreállító funkciót tartalmaz. A programot bővíthetjük macroval, scripttel vagy pluginnal, melyek importálásával számos új funkció érhető el. A biológiai mintákon, jelen esetben sejtpopulációkon, elvégeztem a kvalitatív és kvantitatív méréseket. Megmértem, hogy a sejtekhez (HaCaT, Uveal Melanoma sejtpopulációk) hozzáadott egyes anyagok (Adenozin, Vipera berus-ból származó viperatoxin) hogyan befolyásolják a sejteket sejtszám, illetve a sejtek által elfoglalt terület alapján. A sejtszám meghatározáson belül lehetőség van külön az osztódó és a halott sejtek számának meghatározására is. A HaCaT sejteknél megfigyelhető apoptózis és nekrózis folyamatokat összehasonlítottam a két folyamat időbeli lefutása, valamint a kiindulási és halott sejt átmérőjének változása alapján. A mérésekből kiderült, hogy az apoptózis tovább tart (366 perc), mint a nekrózis (280 perc), valamint az apoptotikus „blebbing” miatt a sejt átmérőjének változása kevésbé ingadozik, mint a nekrózisnál, ahol inflammáció következik be. A HaCaT kontroll sejtpopulációban egy általam kiválasztott sejten megmértem, hogy a monolayer-en belül mekkora az adott sejt mozgástartománya. Eredményként 340,3847 µm hosszúságú szakaszt kaptam.hu_HU
dc.description.correctorgj
dc.description.courseBiológiahu_HU
dc.description.degreeBschu_HU
dc.format.extent36hu_HU
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2437/108136
dc.language.isohuhu_HU
dc.subjectImageJhu_HU
dc.subjectTime-lapsehu_HU
dc.subject.dspaceDEENK Témalista::Biológiai tudományok::Sejtbiológiahu_HU
dc.titleTime-lapse imaging rendszerek kvalitatív és kvantitatív elemzésehu_HU
Fájlok