Szerző szerinti böngészés "Tar, Krisztina"
Megjelenítve 1 - 20 (Összesen 35)
Találat egy oldalon
Rendezési lehetőségek
Tétel Korlátozottan hozzáférhető A Drp1 mitokondriális hasadásért felelős fehérje hatása neuroblasztóma sejtek "in vitro" neurális differenciációjára - globális transzkripciós változások "in silico" analízise.Zöld, Mariann Emese; Tar, Krisztina; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Orvosi Vegytani Intézet; DE--Általános Orvostudományi Kar; Bácsi, Attila; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Immunológiai IntézetA mitokondriumok dinamikus organellumok, amelyek folyamatos fúzión és hasadáson mennek keresztül. Az olyan neurodegeneratív betegségekre, mint például a Huntington kór gyakran jellemző a mitokondriális dinamika felborulása. A Huntington betegségben számos mitokondriális fúzióért és hasadásért felelős fehérje diszregulációját leírták már, például a Drp1 (dynamin-related protein 1), Fis1 (mitochondrial fission 1 protein), Mfn1 (mitofusin 1), Mfn2 (mitofusin 2), OPA1 (optic atrophy protein 1). A laboratóriumban elvégzett kísérlet során a fúziós és a hasadási folyamatban szerepet játszó mitokondriális gének expressziójának változását vizsgáltam egy Drp1-et stabilan csendesített és egy kontroll sejtvonalban. A kísérlethez nem differenciált sejteket használtam és a mitokondriális géneket qPCR-el vizsgáltam. Összesen 8 mitokondriális gént vizsgáltam meg, ezek a következők voltak: OPA1, Mff, MFN2, MFN1, FIS1, MDIV49, MDIV51, DNM1L. Az Mff kivételével ezen gének közül egyik expressziójában sem figyeltem meg változást a Drp1 csendesítés hatására. Az előzetes eredmények arra utalnak, hogy az Mff downregulált, viszont ennek megerősítésére további vizsgálatok szükségesek. Az in silico vizsgálat során nem differenciált, Drp1 csendesített és kontroll sejtvonalon készült RNS szekvenálás eredményét elemeztem. Később a munkacsoport a sejteket retinsavval és BDNF-el (Brain-Derived Neurotrophic Factor) differenciáltatta. A neurális differenciálás első és hatodik napján qPCR-el a következő gének expressziójában bekövetkező változásokat vizsgálták: BANK1, DUSP2, ISLR2, HES7, DEPTOR, ROBO2, DUSP9, INSM1, DRD2, MYCL, GDF-10, NEUROG-2, VEGFA. Az eredmények arra mutattak, hogy a DEPTOR, az ISLR2 és a BANK1 expressziójában szignifikáns változás történt a neurális differenciáció során a Drp1 csendesítés hatására összehasonlítva a differenciált kontrollal. Következtetésként elmondhatjuk, hogy a Drp1 stabil csendesítése a mitokondriális morfológia megváltozását eredményezi. A mitokondrium a Drp1 csendesített sejtek neurális differenciációja során nem rendeződik át és a vizsgált gének expressziója sem mutat szignifikáns eltérést. Ugyanakkor a differenciáció során bizonyos gének expressziója szignifikánsan megváltozik a differenciált kontroll sejtekhez képest.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A proteaszóma aktivátor PA200 transzkripcióban betöltött szabályozó szerepének vizsgálata molekuláris biológiai módszerekkel.Szalma, Ábel Sándor; Tar, Krisztina; Általános Orvostudományi Kar; Általános Orvostudományi Kar::Orvosi Vegytani Intézet; DE--Általános Orvostudományi Kar; Scholtz, Beáta; Általános Orvostudományi Kar; Általános Orvostudományi Kar::Biokémiai és Molekuláris Biológiai IntézetA sejtben a proteaszóma felelős a rosszul feltekeredett, vagy sérült fehérjék lebontásáért. A proteaszóma aktiválásáért a különféle proteaszóma regulátor/aktivátor molekulák felelősek, amelyek a poteaszómához való kötődésük során aktiválják annak proteolitikus aktivitását. A proteaszóma aktivátorok közé tartozik a 19S, a PA28 család tagja, valamint a PA200 molekula is. A PA200 egy körülbelül 200 kDa-os molekula, amely képes a 20S mag proteaszómához egyik, vagy mindkét oldalán kötődni. A PA200 kötődése folytán a proteaszóma fehérjebontó aktivitása megváltozik, oly módon, hogy növekszik a peptidek, valamint az acetilált hisztonok ATP független proteolízise. A sejtet érő különféle stresszhatások következtében a PA200 a sejtmagban pontszerű lokalizációs mintázatot mutat, valamitn stressz hatására megemelkedik az acetilált hisztonok ATP független proteaszómális lebontása. Lehetnek olyan gének a humán genomban, melyek promotéréhez kötődni képes a PA200 és ott transzkripciós faktor funkciót tölthet be. A kísérlet során először optimalizáltuk a PA200 génjét tartalmazó plazmid vektor expresszióját HEK-293 sejtekben. A folyamatot két lépcsőben végeztük el, mely során Western blot segítségével értékeltük ki a kapott eredményeket. Ezt követően megpróbáltuk a feltételezhetően PA200 kötő szekvenciákat plazmid vektorba ligálni. A ligálást követően a vektor DNS-sel transzformáltuk a DH5-α sejteket, majd agarlemezen tenyésztettük és szellektáltuk azokat. Az eredményeket agaróz gélelektroforézis segítségével értékeltük.Tétel Szabadon hozzáférhető All-Trans Retinoic Acid Enhances both the Signaling for Priming and the Glycolysis for Activation of NLRP3 Inflammasome in Human Macrophage(2020) Alatshan, Ahmad; Kovács, Gergő E.; Aladdin, Azzam; Czimmerer, Zsolt; Tar, Krisztina; Benkő, SzilviaTétel Korlátozottan hozzáférhető ASPRV1 és filaggrin expresszió vizsgálata HaCaT sejtek differenciáltatása soránKapczár, Dóra; Tőzsér, József; Nagy, Katalin; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar; Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet; DE--Általános Orvostudományi Kar; Tar, Krisztina; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar; Orvosi Vegytani IntézetA keratinocitákban differenciálódás és seb regenerálódás során expresszálódó bőr specifikus aszpartil proteáz 1 (ASPRV1) proteáz természetes szubsztrátja a filaggrin doménekből felépülő profilaggrin prekurzor molekula. A filaggrin fehérje egy szerkezeti fehérje, melyet a bőrben található transzglutaminázok keresztkötnek a keratin tartalmú citoszkeletális vázzal. A profilaggrin fehérje doménjei közötti összekötő szekvencia hasításáért az ASPRV1 proteáz felelős, az így keletkező filaggrin további degradációs folyamatok következtében természetes hidratációs faktorokká érik, melyek feladata a bőr hidratációja és a környezeti hatásokkal szembeni védelem. Vizsgálataink során arra voltunk kíváncsiak, hogy az immortalizált humán keratinocita HaCaT sejtek differenciáltatása során hogyan változik a filaggrin és az ASPRV1 fehérjék expressziója. Mikroszkóppal követtük a morfológiai és Western blottal vizsgáltuk a biokémiai változásokat. Filaggrin és ASPRV1 ellenes antitesteket alkalmaztunk a cél fehérjék vizsgálatához. A HaCaT sejtek differenciálatlan állapotának fenntartását csökkentett Ca2+ tartalmú (0,2 mM) tápfolyadékkal értük el. A differenciált állapot létrehozásához magasabb Ca2+ tartalmú (1,4 mM) tápfolyadékot alkalmaztunk, 11 napos intervallumban. Az irodalomban leírt morfológiai változásokat a mikroszkópos vizsgálatok során tapasztaltuk. A differenciáltatásos kísérlet során detektáltuk a prekurzor profilaggrin expresszióját és filaggrin fehérjék megjelenését. Csökkentet és magas Ca2+ tartalmú tápfolyadékban HaCaT sebzéses kísérletet végeztük 5 napos intervallumban, mellyel a mechanikai sérülés hatását és a sejt regenerálódást vizsgáltuk. Az ASPRV1 fehérje megjelenésével a profilaggrin processzálását és mennyiségének csökkenését vártuk, valamint a processzálás következtében a rövidebb, kisebb molekulatömegű proteolitikus fragmentek megjelenését.Tétel Korlátozottan hozzáférhető Az atipikusan expresszálodó transzglutamináz 2 hatása a mitokondriális biogenezisre az NB4 akut promielocita leukémia sejtekbenPapp, Albert Bálint; Balajthy, Zoltán; Jambrovics, Károly; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet; DE--Általános Orvostudományi Kar; Tar, Krisztina; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Orvosi Vegytani IntézetMunkánk során megvizsgáltuk, hogy a szöveti transzglutamináz kettő (TG2) hogyan befolyásolhatja a mitokondriális biogenezist az NB4 akut promielocita leukémia (APL) sejtek all-transz retinsav (ATRA) indukálta differenciációja során. Az ATRA egy az APL kezelése során alkalmazott ágens, mely a kóros promielociták terminális differenciációját (neutrofil granulocitává), és apoptózisát indukálja, melyek során megemelkedik a TG2 transzkripciója. A TG2 egy multifunkcionális enzim, számos aktivitással (pl. protein diszulfid izomeráz, GTPáz), melyek közül a kalcium dependens keresztkötő aktivitása a legkiemelkedőbb, mivel fehérje szerkezeteket, interakciókat módosítva számos folyamatot, akár génexpressziót is befolyásolhat. Kísérleteink során meghatároztuk a mitokondriális respirációs lánc és energiatermelés, mitokondriális biogenezis elemeinek és szabályozóinak a gén és fehérje szintű expreszzióját TG2 vadtípusú, víruskontroll és TG2 hiányos (knockdown, knockout) NB4 sejtvonalakban. Eredményeink alapján feltételezhető, hogy a TG2 nem befolyásolja a mitokondriális ATP termelést, a mitokondriális biogenezist PARK2 útvonalon, illetve ATRA kezelés hatására TG2 függetlenül a BCL2A1 génexpressziója szignifikánsan megemelkedett a kezeletlen sejtekhez képest. A fokozott BCL2A1 expressziója fontos szerepet tölthet be az NB4 neutrofil granulociták túlélésében.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A Blm10/PA200 proteaszóma aktivátor család szerepének vizsgálata a mitokondrium homeosztázisának fenntartásábanCzinege, Rita; Tar, Krisztina; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA Blm10/PA200 szerepének vizsgálata a mitokondrium homeosztázisára, különböző mitokondriális fehérjék szabályozott lebontásán keresztül, mint a Dnm1/Drp1. A PA200 depléciójának hatása a sejtek életképességére és a mitokondrium struktúrájára.Tétel Szabadon hozzáférhető Cells Lacking PA200 Adapt to Mitochondrial Dysfunction by Enhancing Glycolysis via Distinct Opa1 Processing(2021) Douida, Abdennour; Batista, Frank; Botó, Pál; Regdon, Zsolt; Robaszkiewicz, Agnieszka; Tar, KrisztinaTétel Korlátozottan hozzáférhető Effect of palmitate treatment (high fat diet) on the phagocytosis of apoptotic cells by RAW264.7 mouse macrophagesOdono, Amaechi Eze; Szondy, Zsuzsa; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet; DE--Általános Orvostudományi Kar; Tar, Krisztina; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar; Orvosi Vegytani IntézetThe thesis deals with investigation of the effect of high fat diet (HFD) on the accumulation of apoptotic cells found in obese individuals. How this affects the engulfment of the apoptotic cells by macrophages and the gene expression levels of the genes involved in the apoptotic cell clearance.Tétel Korlátozottan hozzáférhető Estrogen regulation of Notch signalling pathwayAzadova, Aygun; Bálint, Bálint László; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar; Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet; DE--Általános Orvostudományi Kar; Tar, Krisztina; Debreceni Egyetem, Általános Orvostudományi Kar; Orvosi Vegytani IntézetEstrogen receptor signaling pathway regulates breast cancer formation, proliferation, survival and metastasis.Tétel Szabadon hozzáférhető Exploring the diverse cellular functions of the proteasome activator PA200Douida, Abdennour; Tar, Krisztina; Molekuláris orvostudomány doktori iskola; DE--Általános Orvostudományi Kar -- Orvosi Vegytani IntézetThe conserved Blm10/PA200 family belongs to the proteasome activators. PA200 alternatively binds to the proteasome core particle (CP) and facilitates peptide degradation in an ATP and ubiquitin-independent manner. PA200 has several important physiological roles, such as DNA repair, spermatogenesis, and aging. However, the exact molecular mechanisms behind these functions are not clear. In the present study, we investigated new promising functions of PA200 and the consequences of PA200 stable depletion at the normal condition and upon mitochondrial stress. First, we investigated the role of PA200 on cell viability and apoptosis with or without mitochondrial stress. We have found that PA200 deficient cells are more sensitive to rotenone but not oligomycin and antimycin A treatment. Furthermore, PA200-deficient cells exhibit low expression of c-Jun upon rotenone treatment, thereby; reducing the capacity of PA200 depleted cells to tolerate the rotenone-induced cell death. Second, we performed ChIP followed by ChIP-sequencing analysis to study the possible role of PA200 as a transcription factor or cofactor that regulates the transcription machinery. We have demonstrated that PA200 is a chromatin component in SH‐SY5Y neuroblastoma cells and it binds to promoter regions of genes involved in the cell cycle, metabolism, and protein modification. Third, we performed an RNA sequencing study. We found that the loss of PA200 has an overall change in the transcriptomic profile of the SH-SY5Y cell line. Functional annotation analysis of differentially expressed genes (DEGs) revealed that PA200 has a crucial role in cellular functions including apoptosis, metabolism, cell cycle, MAPK signaling pathway, and mitochondrial homeostasis. Furthermore, the extracellular flux analysis of shPA200 and control cells indicates mitochondrial dysfunction and a significant increase in glycolysis in PA200 deficient cells. Further investigations of mitochondrial mass show a significant reduction in mitochondrial ETC biogenesis upon loss of PA200. Finally, mitochondrial morphology analysis shows significant increase in fused mitochondria in shPA200 cells, compared to control cells upon oligomycin treatment due to maintenance of L-OPA1 isoforms. Our new findings provide more information regarding the role of PA200 in eukaryotic cells. The new disclosed functions of PA200 in the maintenance of mitochondrial integrity and cell survival may contribute to the development of new therapy for many diseases related to mitochondrial dysfunction including but not limited to neurodegenerative disease, cardiovascular disease, and aging.Tétel Korlátozottan hozzáférhető Exploring the impact of Serine39 (S39A) mutation of the Dynamin-related protein (Drp1) on mitochondrial dynamics of human neuroblastoma cellsAlkhatibe, Mahmoud; Tar, Krisztina; Medical Chemistry; DE--Általános Orvostudományi Kar; Szabó, András; Department of Biochemistry and Molecular Biology, Faculty of MedicineDrp1 function and mechanism in mammalian cells have been extensively studied, and multiple attempts were carried out for a better understanding of the enzymatic activity of the protein and its mechanism in mitochondrial fission. Additionally, the involvement of Drp1 in several diseases and its interaction with pathological intermediates associated with mitochondrial fission dysfunction raised many questions concerning the development of diseases. However, the exact molecular mechanism behind these interactions and the molecular function of Drp1 remains incompletely covered. In the present study, we investigated a specific site of Drp1 protein in the first domain responsible for the GTPase activity and its expected function and mutational consequences under the normal condition on the mitochondrial dynamics. The induced Ser39Ala mutation has initially exhibited highly fused mitochondria. We transfected SH-SY5Y cells with a sitedirected mutated construct of Drp1 protein and investigated the observed changes in mitochondrial morphology. Statistical analysis revealed increased mitochondrial fusion of shDrp1 S39A cells. The disclosed involvement of this site in the GTPase activity, hence mitochondrial dynamics, may contribute to a better understanding of the protein’s functional domain and its role in neurodegenerative diseases, and perhaps explore therapeutical approaches.Tétel Korlátozottan hozzáférhető Genetikai kód és fehérje szintézis(2021) Tar, Krisztina; Gergely, Pál; DE--Általános Orvostudományi Kar--Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet; Tar, KrisztinaTétel Szabadon hozzáférhető How Do Post-Translational Modifications Influence the Pathomechanistic Landscape of Huntington's Disease? A Comprehensive Review(2020) Lontay, Beáta; Kiss, Andrea; Virág, László; Tar, KrisztinaTétel Szabadon hozzáférhető Human Urinary Epithelial Cells as a Source of Engraftable Hepatocyte-Like Cells Using Stem Cell Technology(2016) Sauer, Vanessa; Tchaikovskaya, Tatyana; Wang, Xia; Li, Yanfeng; Zhang, Wei; Tar, Krisztina; Polgár, Zsuzsanna; Ding, Jianqiang; Guha, Chandan; Fox, Ira J.; Roy-Chowdhury, Namita; Roy-Chowdhury, JayantaTétel Korlátozottan hozzáférhető A Huntington-kór és a kialakulásában szerepet játszó proteoszomális folyamatok.Szalma, Ábel Sándor; Tar, Krisztina; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA Huntington-kór általános jellemzése. A betegség mögött rejlő molekuláris folyamatok ismertetése, valamint, hogy a proteoszómára miként hatnak ezekhez a folyamatok. A betegség során termelődő mutáns fehérjének milyen negatív hatásai vannak a sejtre, illetve, hogy a sejt ezeket a hatásokat miként tudja kezelni.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A koffein szerepének vizsgálata humán makrofágok gyulladásos folyamataibanBecsei, Ágnes; Benkő, Szilvia; Budai, Marietta; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Élettani Intézet; DE--Általános Orvostudományi Kar; Tar, Krisztina; Debreceni Egyetem::Általános Orvostudományi Kar::Orvosi Vegytani IntézetAz immunrendszer első védelmi vonalának kialakításában a makrofágok kiemelkedő szerepet játszanak. A gyulladásos citokinek (IL-1β, TNFα, IL-8, IL-6) termelésével hozzájárulnak a szöveti gyulladás fenntartásához, majd a gyulladást követő szöveti regenerációt anti-inflammatórikus citokinek (IL-10) szekréciójával segítik. Az IL-1β, a legtöbb citokintől eltérően proformaként keletkezik, melyet egy intracelluláris fehérje komplex, az NLRP3 inflammoszóma hasít érett IL-1β-vá. Az NLRP3 inflammoszóma működése két szignált igényel. Az első szignál (LPS) az inflammoszóma alegységek, valamint a pro-IL-1β transzkripcióját eredményezi. A második szignál (ATP) a komplex összeállásához, aktiválásához és a pro-IL-1β hasításához szükséges. Az inflammoszóma működését számos tényező befolyásolhatja. Munkánk során a koffein hatását vizsgáltuk, mely egyéb élettani hatásai mellett a gyulladás szabályozásában is kiemelkedő szerepet játszik, valamint több, az NLRP3 inflammoszóma működéssel kapcsolatos betegséggel (diabétesz, Alzheimer-kór) is összefüggésbe hozták. A humán vérből szeparált monocitákat M-CSF jelenlétében makrofágokká differenciáltattuk, majd bakteriális lipopoliszachariddal (LPS), ATP-vel és koffeinnel kezeltük. A makrofágok citokin termelését ELISA-val mértük. A pro-IL-1β és az NLRP3 inflammoszóma tagok mRNS expresszióját qPCR, a fehérje kifejeződését Western blot módszerrel vizsgáltuk. Eredményeink szerint a koffein fokozza az LPS és ATP kezeléssel stimulált makrofágok IL-1β, IL-8 és IL-6 termelését, de érdekes módon a TNFα szekréciójukat csökkenti, valamint az anti-inflammatórikus IL-10 felszabadulást is visszafogja. A pro-IL-1β és az NLRP3 inflammoszóma tagok expressziója mind mRNS, mind fehérje szinten fokozódik koffein kezelés hatására, ami hozzájárul a makrofágok növekedett IL-1β termeléséhez. A TNFα és az IL-1β egyike a legfontosabb gyulladásos citokineknek és a reguláló hatásuk hasonló. A koffein ellentétes hatásának hátterében a citokinek szekréciójának eltérő mechanizmusa állhat. A koffein az adenozin receptorok vagy éppen az intracelluláris kálciumszint szabályozásán keresztül befolyásolhatja a biológiai folyamatokat, melyek hatással lehetnek az inflammoszóma aktiválódására.Tétel Korlátozottan hozzáférhető Mitokondriális aktivitás és dinamika a Huntington kórbanSzabó, Edina; Tar, Krisztina; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA neurodegeneratív betegségek az idegrendszer egyes sejtcsoportjait támadják meg, melyekre jelenleg sajnos nincs gyógymód. Egyes tüneteket enyhíthetünk, illetve az időben diagnosztizált betegség lefolyását késleltetni lehet bizonyos gyógyszerek, kezelések segítségével, de a betegségek gyógymódjának megtalálása még várat magára. Ezen betegségek nagyon összetettek, így a gyógymódok megtalálása sem egyszerű.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A mitokondriális hasadásért felelős Drp-1 fehérje mutánsainak létrehozásaSzabó, Bernadett; Tar, Krisztina; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA mitokondrium egy dinamikusan változó, folyamatosan osztódó és egyesülő sejtszervecskék összessége. Ezeknek a folyamatoknak az egyensúlya nagyon fontos a mitokondrium és a sejt megfelelő működésének érdekében, hiszen a benne keletkező defektek komoly problémákhoz vezethetnek, amit több betegségben is kimutattak már. A hasadás legfontosabb fehérjéje a Drp-1, amely adaptorfehérjékhez kötődve végzi el a hasadási folyamatot. Szakdolgozatom során ennek a fehérjének bizonyos pontjain mutációkat végeztünk, amelyet később szekvenálással ellenőriztünk.Tétel Korlátozottan hozzáférhető A mitokondrium hasadásáért felelős Drp1 fehérje rekombináns mutánsainak vizsgálataVadászi, Karina Klára; Tar, Krisztina; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetSzakdolgozatom a Drp1 fehérje rekombináns mutánsainak vizsgálatáról szól. Megfigyeltük a mutáns fehérjék eloszlását a humán neuroblasztóma sejtekben. A Drp1 fehérje kulcsszerepet tölt be a mitokondrium osztódásában. Arra kerestük a választ, hogy a mutánsok ezt miként befolyásolják. A mitokondrium hibás működése neurodegeneratív betegségek kialakulásához vezet. Ezért fontos a mitokondrium pontos működésének feltárása.Tétel Korlátozottan hozzáférhető Neurodegeneratív betegségek molekuláris biológiája, különös tekintettel a Huntington-kórraVarga, Luca Anna; Tar, Krisztina; DE--Természettudományi és Technológiai Kar--Biológiai és Ökológiai IntézetA szakdolgozat a neurodegeneratív betegségek bemutatására törekszik, a Huntington-kórt részletesebben tárgyalja. Kitér a Drp1, a mitokondrium és a betegség kapcsolatára is. A molekuláris hátteret vizsgálva egy összefoglaló képet ad az elváltozásokról és következményeiről. A dolgozathoz kapcsolódó laboratóriumi módszerek és anyagok ismertetése is megtalálható benne. A szakmai hátteret különböző tudományos cikkek biztosították.